Система капиллярного электрофореза, на 12 образцов, для анализа ДНК, РНК, белков и клеток без ПК, Bioanalyzer 2100, Agilent Technologies, Agilent Technologies

Система Bioanalyzer 2100 использует микрофлюидную технологию LabChip, обеспечивает высокую точность результатов при минимальных объемах исследуемого образца. В системе используется два принципа анализа: электрофореза и проточной цитометрии.

• Источник света — светодиодный лазер;
• длина волны эмиссии, нм — 635;
• фотоэмиссионный детектор;
• длина волны детекции, нм — 685;
• фильтры эмиссии, нм — 488, 638 нм;
• формат — 16-луночные чипы;
• подключение к ПК — USB 2.0;
• габариты, ШхГхВ, мм — 162 × 412 × 290;
• вес, кг — 10.

Принцип работы: в системе применяют готовые чипы, заполненные агарозным гелем. Движение фрагментов ДНК в капилляре, как и в "классической" методике, происходит под действием тока. Для определения размеров НК, белков используют маркеры, окрашенные интеркалирующими и флуоресцентными красителями.

В случае применения цитометрического модуля: клеточная суспензия, предварительно меченная флюоресцирующими моноклональными антителами или флуоресцентными красителями, попадает в поток жидкости, проходящий через проточную ячейку. Условия подобраны таким образом, что клетки выстраиваются друг за другом за счет т. н. гидродинамического фокусирования струи в струе. В модуле возможно изучение зелёной и красной флуоресценции. Все результаты обрабатываются с помощью ПО 2100 Expert.

Области применения:

• приготовление библиотек при проведении NGS на секвенаторах ДНК HiScan SQ, HiSeq 2000, MiSeq (Illumina); 5500 xl W, 5500w, Ion Torrent IonProton, Ion Torrent PGM (Life Technologies); GS FLX+, GS Junior (Roche);
• подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования;
• выделение белков и НК;
• контроль качества синтезированной in vitro матричной РНК, контроль чистоты выделенной РНК (RIN - RNA Integrity Number);
• определение уровня апоптоза;
• оценка жизнеспособности и пролиферации клеток;
• оценка экспрессии белков в результате связывания с антителами;
• оценка экспрессии белков с помощью зелёного флуоресцентного белка (green fluorescent protein, GFP);
• оценка эффективности трансфекции миРНК (siRNA).

Преимущества:

• система позволяет анализировать ДНК, РНК, белки, клетки с использованием одного прибора;
• чувствительность, пг/мкл — 5 (для ДНК), 50 (для РНК), 1 (для белков);
• максимальная загрузка чипа — до 12 образцов на один чип;
• объем исходного образца, мкл — 1 (для ДНК и РНК), 4 (для белков), 10 мкл (для клеток);
• время анализа, мин — 25-45, в зависимости от используемого чипа.

Комплект поставки: станция подготовки чипов Chip priming station; вортекс IKA; ПО 2100 Expert, набор для электрофореза (приобретается дополнительно), набор для проточной цитометрии (приобретается дополнительно), ПК или ноутбук (приобретается дополнительно).

Характеристики чипов:

Образцы	High Sensitivity DNA	DNA 1000	DNA 7500	DNA 12000
Диапазон размеров, п.н.	50-7000	25-1000	100-7500	100-12000
Диапазон концентраций	5-500 пкг/мкл	0,5-50 нг/мкл	0,5-50 нг/мкл	0,5-50 нг/мкл
Время анализа, мин	45	35	30	30
Число образцов	11	12	12	12

Образцы	Protein 80	Protein 230	High Sensitivity Protein 250
Диапазон размеров, кДа	5-80	14-230	10-250
Диапазон концентраций	60-2000 нг/мкл	15-2000 нг/мкл	0,3-3000 нг/мкл
Время анализа, мин	30	25	30
Число образцов	10	10	10

Образцы	Клетки
Красный канал	возбуждение – 620-645 нм; эмиссия – 674-696 нм.
Синий канал	возбуждение – 458-482 нм; эмиссия – 510-540 нм.
Минимальная клеточная пропускная способность	2,5 клетки / секунды
Минимальная плотность, кл/мл	2,0 x 10⁶
Время анализа, мин	30
Количество образцов	6
Объём образца, мкл	10 (клеток 2 x 10⁴ в мл)