Видео. Рабочий процесс секвенирования на платформе Ion GeneStudio S5 со станцией пробоподготовки Ion Chef, Thermo FS, англ., 2018 г.

Идентификация видов, присутствующих в образцах пищевых продуктов и кормах, является важным критерием для подтверждения подлинности, проверки происхождения, отслеживаемости сырья и для контроля качества процессов обработки на линиях производства.

Рабочий процесс Thermo Scientific NGS Food использует технологию секвенирования следующего поколения Ion Torrent для обеспечения нецелевого подхода к скринингу, позволяющего идентифицировать виды, содержащиеся в пищевых образцах как однокомпонентного, так и многокомпонентного сырья, путем сравнения с базой данных ДНК видов мяса, растений или рыб.

Ключевая особенность секвенатора ДНК 2-го поколения Ion GeneStudio S5:

• сокращение времени работы и сложности – реактивы plug-and-play на основе картриджа;
• быстрое получение результатов анализа – полный цикл секвенирования и анализ за часы;
• гибкая пропускная способность – выбрать чип, соответствующий вашим требованиям к пропускной способности (набор микросхем Ion 510 или 520 для идентификации видов пищевых продуктов).

Система Ion GeneStudio S5 использует скорость полупроводникового секвенирования, которая обеспечивает получение высококачественных данных секвенирования за несколько часов и позволяет перейти от библиотеки ДНК к данным всего за 24 часа. Благодаря однодневной установке, простому пользовательскому интерфейсу и картриджам с реагентами система Ion GeneStudio S5 проста и удобна в использовании.

Преимущества автоматизированного NGS-скрининга для мультивидовой идентификации:

• детекция всех мишеней (мясо, рыба и растения) в одном запуске;
• надежные результаты образцов из нескольких категорий продуктов питания (готовые к употреблению блюда, свежие продукты, супы, консервы и т. д);
• реагенты на основе картриджей «включай и работай»;
• быстрые результаты – полный цикл секвенирования и анализ за 24 часа;
• секвенирование ДНК – наиболее достоверный метод для подтверждения вида;
• методика определения вида методом секвенирования соответствует международному стандарту ISO TC 34/SC 16 ISO 22949-1 и ГОСТ 34106-2017.

• Совместимые чипы — Ion 510, Ion 520, Ion 530, Ion 540, Ion 550;
• время секвенирования от 2,5 до 4 часов;
• ПО Torrent Suite — первичный анализ данных, Ion Reporter — вторичный анализ и аннотация данных;
• при использовании чипов Ion 540 и Ion 550 анализ результатов с первого чипа производится одновременно со вторым запуском;
• размеры, Ш × Г × В, см — 54,2 × 80,6 × 50,9;
• вес — 63,5 кг.

• Совместимые чипы — Ion 510, Ion 520, Ion 530, Ion 540, Ion 550;
• время секвенирования от 2,5 до 4 часов;
• ПО Torrent Suite — первичный анализ данных, Ion Reporter — вторичный анализ и аннотация данных;
• размеры, Ш × Г × В, см — 54,2 × 80,6 × 50,9;
• вес — 63,5 кг.

• Совместимые чипы — Ion 510, Ion 520, Ion 530, Ion 540;
• время секвенирования от 2,5 до 4 часов;
• ПО Torrent Suite — первичный анализ данных, Ion Reporter — вторичный анализ и аннотация данных;
• размеры, Ш × Г × В, см — 54,2 × 80,6 × 50,9;
• вес — 63,5 кг.

• Упрощает и автоматизирует процесс подготовки матрицы и загрузки чипов;
• помогает снизить вариабельность получаемых результатов для пользователей любого уровня;
• помогает экономить время и силы — на ручную подготовку запуска уходит всего 15 минут, за один запуск система загружает один или два полупроводниковых чипа Ion для секвенирования;
• совместимость с секвенаторами — Ion GeneStudio S5/Plus/Prime, Ion S5/S5 XL, Ion Proton и Ion PGM;
• совместимость с чипами — все полупроводниковые чипы Ion;
• совместимость с библиотеками — подходит для подготовки матриц для широкого спектра ДНК- и РНК-библиотек, в том числе библиотек Ion AmpliSeq;
• мощность, Вт — 1350;
• габариты, Ш × Г × В, см — 71,4 × 70 × 56,1;
• вес, кг — 68,2.