Сканер GeneChip™ 3000 7G предназначен для проведения хромосомного микроматричного (ХМА) анализа, позволяющего проанализировать структуру всего генома в одном исследовании используя SNP-однонуклеотидные матрицы.
Области применения:
хромосомный микроматричный анализ позволяет обнаружить:
вариации числа копий ДНК (CNV) всего генома, включая:
микроделеции/микродупликации размером от 1 тыс. п.н. до млн. п.н (и точное определение их генного состава);
анеуплоидии;
несбалансированные транслокации;
точное определение точек разрыва;
мозаицизм;
нарушение плоидности;
участки потери гетерозиготности (LoH), включая копий-нейтральные участки потери гетерозиготности (cnLoH);
хромотрипсис;
определить точечные полиморфизмы (SNP);
выявить частые мутации в генах;
определить видовую принадлежность ДНК;
провести анализ экспрессии генов.
Применения в клинической практике:
в пренатальной диагностике для поиска хромосомной патологии плода;
в постанальной диагностике для детей со множественными пороками развития, задержкой развития, аутизмом;
для анализа постабортного материала для установления причины потери беременности;
в онкологии для исследования опухолевых клеток.
Применения в агрогенетике:
идентификация и паспортизизация сорта и породы сельскохозяйственных растений и животных;
ДНК-скрининг селекционных маркеров при скрещивании и выявлении наследуемых патологий.
Принцип работы:
Для проведения хромосомного микроматричного анализа используется твердый носитель небольшого размера (микроматрица) из стекла или кремния. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды (8-80 нп) или фрагменты ДНК/РНК (более 100 нп).
Матрицы, используемые для хромосомного микроматричного анализа, содержат до 2,7 млн. специфических олигонуклеотидов. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. За счет высокой плотности маркеров можно определить минимальные потери/увеличение генетического материала всех регионов генома.
Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов (SNP), анализа копийности любых участков генома (CNV), определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов.
Комплектация:
Система GeneChip™ Scanner 3000 7G System включает в себя:
сканер GeneChip Scanner 3000 7G;
промывочные станции Fluidics Station 450;
гибридизационную печь Hybridization Oven 645.
Рабочий процесс, проводимый системой GeneChip™ Scanner 3000 7G System, включает в себя амплификацию ДНК, далее фрагментацию и гибридизацию ДНК, затем лигирование, отмывку и визуализацию.
Эту систему можно приобрести с или без мощной компьютерной рабочей станции с четырехъядерными Xeon процессорами, сервера Affymetrix GeneChip Command Console (AGCC) и GeneChip AutoLoader.
Анализ полученных данных осуществляется с помощью бесплатных и постоянно обновляемых программ:
Chromosome Analysis Suite (ChAS): для анализа числа копий;
Multi-Sample Viewer (MSV): для анализа числа копий и соматических мутаций у большого количесва образцов одновренменно;
Somatic Mutation Viewer 1.1, для соматичесих мутаций;
Nexus Express Software для анализа числа копий и соматических мутаций.
Особенности прибора:
компактный размер для лучшего использования пространства;
сканирование с более высоким разрешением от 0,51 до 2,5 мкм пикселизации, автоматически выбираемые по типу микроматрицы;
оптимальная однородность изображения и эффективность сбора всей области сканирования благодаря запатентованной технологии Applied Biosystems™ Flying Objective™;
отсутствие дрейфа лазера и снижение вариабельности от сканера к сканеру;
автоматическая регулировка коррекции остаточной дуги и x-линейности;
совместимость с автозагрузчиком GeneChip Autoloader для самостоятельного сканирования до 48 микроматриц одновременно.
Технические характеристики системы:
время сканирования: 5-45 минут на один картридж в зависимости от типа микроматрицы;
габариты, Г × В × Ш, см: 33 x 56 x 58 см, дополнительно 20 см к высоте для GeneChip AutoLoader;
контроллер сетевого интерфейса: Разрабатан с предустановленными и специализированными платами для контроля GeneChip Scanner или Applied Biosystems™ GeneChip™ Fluidics Station;
Система GeneTitan Multi-Channel — автоматическая высокопроизводительная станция для хромосомного микроматричного анализа (ХМА), анализа экспрессии генов, полногеномного SNP генотипирования и анализа микробиома, позволяет параллельно обрабатывать большое количество образцов без присмотра оператора.
Система GeneTitan Multi-Channel обьединяет в себе печь гибридизации, отмывочные станции и устройство визаулизации, что позволяет полностью автоматизировать процесс проведения анализа.
Данная система поддерживает 16-, 24-, 96- и 384-луночные микроматричные планшеты, благодаря чему становится возможным единовременное и автоматическое проведение анализа большого количества образцов.
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) позволяет обнаружить:
вариации числа копий ДНК (CNV) всего генома, в т.ч.:
микроделеции/микродупликации размером от 1 тыс. до млн. п.н (и точное определение их генного состава);
анеуплоидии;
несбалансированные транслокации;
точное определение точек разрыва;
мозаицизм;
нарушение плоидности;
участки потери гетерозиготности (LoH), включая копий-нейтральные участки потери гетрозиготности (cnLoH);
хромотрипсис;
определить точечные полиморфизмы (SNP);
выявить частые мутации в генах;
определить видовую принадлежность ДНК;
провести анализ экспрессии генов.
Применения в клинической практике:
в пренатальной диагностике для поиска хромосомной патологии плода;
в постанальной диагностике для детей со множественными пороками развития, задержкой развития, аутизмом;
для анализа постабортного материала для установления причины потери беременности;
в онкологии для исследования опухолевых клеток.
Применения в агрогенетике:
идентификация и паспортизизация сорта и породы сельскохозяйственных растений и животных;
ДНК-скрининг селекционных маркеров при скрещивании и выявлении наследуемых патологий.
Принцип работы:
Для проведения ХМА используется твердый носитель небольшого размера (микроматрица) из стекла или кремния. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды (8-80 н.п.) или фрагменты ДНК (более 100 н.п.).
Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 2,7 млн. специфических олигонуклеотидов. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. За счет высокой плотности маркеров можно определить минимальные потери/увеличение генетического материала всех регионов генома.
Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов (SNP), анализа копийности любых участков генома (CNV), определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов.
Этапы работы Системы GeneTitan Multi-Channel
Рабочий процесс, проводимый системой GeneTitan Multi-Channel, включает в себя амплификацию ДНК, далее фрагментацию и гибридизацию ДНК, затем лигирование, отмывку и визуализацию. Анализ полученных данных проводится с помощью бесплатных программ RHAS, MSV, ChAS.
GeneTitan Multi-Channel работает без присмотра в течение ночи, обеспечивая в 10 раз большую производительность по сравнению с другими платформами, а уникальная степень автоматизации означает превосходную воспроизводимость и повышенную уверенность в ваших результатах:
всего 30 минут для любой микроматрицы, изображения микроматрицы менее, чем за 5 минут, работает без присмотра специалиста в течение ночи;
удовлетворяет потребности как в средней, так и в высокой пропускной способности, позволяет сократить время обработки данных при меньшем количестве ресурсов;
есть возможность проводить исследования экспрессии генов и генотипирования на различных микроматрицах;
предназначена для получения высококачественных согласованных данных путем обработки нескольких образцов в идентичных условиях;
создание гибких рабочих процессов и регистрация образцов с помощью программного обеспечения GeneChip Command Console (AGCC).
Комплектация GeneTitan Multi-Channel:
GeneTitan Multi-Channel Instrument;
рабочая станция;
внешний считыватель штрих-кода;
ПО командной консоли Applied Biosystems GeneChip (AGCC);
APC Smart UPS 1500;
ксеноновая дуговая лампа Lambda LS;
система управления Lambda SC SmartShutter;
запасная ксеноновая лампа;
стеклянные бутылки для Wash A/B, DI water и waste;
Набор предназначен для определения аллелей А и В гена каппа-казеина крупного рогатого скота. Эти аллели являются маркерами молочной продуктивности коров и отличаются нуклеотидами, кодирующими аминокислотные остатки в 136 и 148 положениях в последовательности каппа-казеина, что влияет, в свою очередь, на термостабильность этого белка. Вариант А несёт треонин в 136 положении и аспарагиновую кислоту в 148 положении, вариант В - изолейцин и аланин, соответственно. Молоко, полученное от носителей аллеля В, характеризуется более высоким содержанием белка, способностью образовывать мицеллы меньшего размера, повышенной термостабильностью и считается более подходящим сырьём для производства творога и сыра.
Определение аллельного полиморфизма гена каппа-казеина производится методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RFLP) — расщепления специфических ПЦР-продуктов эндонуклеазами рестрикции с последующим электрофоретическим разделением фрагментов, полученных в ходе рестрикции. В качестве матрицы для ПЦР используется геномная ДНК крупного рогатого скота.
Набор реагентов для экспресс-экстракции ДНК из образца при помощи специальных мембран (Q-Dip) и прямой ПЦР видоспецифичных участков с полиморфизмом длины гена цитохрома b митохондриальной ДНК 5 видов животных (козел – 159 п.н., курица – 228 п.н., корова – 273 п.н., овца – 334 п.н., свинья – 396 п.н.).
Детекция целевых ПЦР-продуктов проводится путем фрагментного анализа в неденатурирующих условиях с использованием интеркалирующего красителя на системах капиллярного электрофореза серии Qsep.
Анализ данных проводится при помощи стандартного ПО Q-Analyser.
Анализ одно- и многокомпонентной продукции;
анализ сырого мяса либо переработанной готовой продукции.
формат — 96-луночные планшеты или 8-луночные стрипы;
количество детектируемых мишеней — 6;
два типа картриджей: 125 инъекций (500 образцов) и 250 инъекций (1000 образцов);
универсальный полимер (POP-1) для секвенирования и фрагментного анализа;
не требует спектральной калибровки при использовании наборов Applied Biosystems;
встроенное ПО для управления SeqStudio Data Collection;
подключение к ПК – не обязательно;
мощность (без компьютера), Вт — 271;
габариты, Ш × Г ×В, мм — 495 × 648 × 442;
вес, кг — 45,4.
Особенности:
Универсальный — единый формат расходных материалов (универсальный картридж) и для секвенирования, и фрагментного анализа. Широкий спектр задач — весь спектр приложений капиллярного электрофореза в ваших руках. Компактный — секвенатор размером с амплификатор. Комплексный — компьютер и ПО встроены в прибор. Первичный анализ данных осуществляется в режиме реального времени. Надежный — проверенные временем технологии. Научные, медицинские, криминалистические лаборатории всего мира доверяют данным этих генетических анализаторов. Простой— запуск прибора занимает всего несколько минут. Все необходимое для работы прибора в одном картридже, который хранится непосредственно в приборе.
Программное обеспечение:
Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
Комплект поставки: генетический анализатор SeqStudio (с основным ПО), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, ноутбук с установленной программой управления и сбора данных и анализа, стартовый набор для запуска прибора (4-х капиллярный картридж, протектор, катодный буфер, необходимые расходные материалы).
Дополнительно: однодневное обучение генетическому анализу.
Высокопроизводительная система капиллярного электрофореза.
Количество капилляров в блоке — 48 или 96;
улучшенный лазер с охлаждением;
блок детекции — утонченная с обратной стороны ССD-камера, обеспечивает низкий шум и полный сбор данных от всех капилляров одновременно;
количество детектируемых мишеней — 6;
формат планшет — 96 или 384 лунки;
производительность за запуск, п.н. — 38,4 - 96,0 × 10³;
система контроля и оптимизации расхода полимера;
совместимые типы полимера — POP-7, POP CAP;
автоматическая замена геля;
автоматическая работа 48 часов без оператора;
автозагрузчик планшет;
встроенный считыватель штрих-кодов;
обязательное подключение к ПК;
индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
габариты, Ш × Г × В, мм — 1000 × 650 × 930;
вес, кг — 130.
Комплект поставки: генетический анализатор 3730xl (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), капиллярный блок на 96 капилляров, кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.
Программное обеспечение:
Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
В клетке могут встречаться редкие мутации, например лишь в одной из нескольких сотен клеточных митохондриальных ДНК. В общей смеси при обычном ПЦР при таком сильном разведении эти мутации невозможно обнаружить. Похожая картина нередко наблюдается в отношении минорных опухолевых мутациях. Цифровой капельный ПЦР (Droplet Digital PCR) – усовершенствованный метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), при котором реакционная смесь после добавления ДНК распыляется на множество мельчайших капель, попадающих на лунки чипа. Чип может содержать несколько десятков тысяч ячеек, на которых в каплях протекает ПЦР. При этом возможна визуализация результата реакции с каждой ячейки. По завершению реакции данный чип может быть использован для проведения секвенирования или клонирования с каждой капли.
Система QX200 Droplet Digital PCR предназначена для проведения цифровой капельной ПЦР третьего поколения, позволяющей добиться высочайшей точности и достоверности результатов. QX200 обеспечивает абсолютную количественную оценку ДНК- и РНК-мишеней как с помощью зондов так и с помощью интеркалирующего красителя EvaGreen, исключая использования калибровочных кривых .
Система включает в себя QX200 Droplet Generator (генератор микродисперсионных капель из кДНК или РНК-содержащих образцов) и QX200 Droplet Reader (позволяет осуществлять сверхчувствительный и точный автоматический анализ продуктов амплификации).
Преимущества цифрового капельного ПЦР по сравнению с RТ ПЦР:
гибкость системы и оптимизация ее для EvaGreen и TaqMan зондов любых производителей;
сверхчувствительность и сверхточность количественного анализа продуктов амплификации гена-мишени в каждой капле образца;
фракционирование образцов на нанокапли сводит к минимуму влияние на результат исследований таких параметров как наличие ингибиторов ПЦР и эффективности;
протекания амплификации за счет абсолютного подсчета гена-мишени в каждой капле;
отсутствие необходимости использования калибровочных кривых;
прямое обнаружение редкого варианта гена-мишени в сложном окружении.
Количественная оценка биомаркеров рака. Мутациям, ассоциированным с онкологией, часто удаётся избежать детектирования из-за их низкой концентрации по сравнению с фоновой ДНК дикого типа в том же образце. За счёт высокой чувствительности система QX200 позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001% (!) - одна на сто тысяч.
Обнаружение и оценка возбудителей заболеваний. Точная количественная оценка вирусной нагрузки крайне важна для определения состояния заболевания, разработки, утверждения и оценки эффективности терапии. QX200 обладает чувствительностью достаточной для обнаружения сверхмалых количеств вирусного генетического материала и в том числе и в сложных смесях
Определение количества копий гена (CNV). Вариации числа копий гена (CNV) является значимым источником полиморфизма в геноме человека. CNV ассоциируется с раком, неврологическими и аутоиммунными заболеваниями, а также с побочными эффектами при воздействии лекарственных средств. QX200 позволяет определить CNV с точностью соотношения 1.2х (!), например, пять против шести.
Валидация и количественная оценка библиотек NGS. С помощью технологии цифровой ПЦР можно качественно и количественно оценить библиотеку, что позволяет наиболее эффективно использовать секвенаторы.
Анализ экспрессии генов. Капельная цифровая ПЦР позволяет количественно определить уровень экспрессии гена. Благодаря высокой точности и чувствительности метода возможна оценка минимального 10% (!) изменения экспрессии, в том числе и при низких концентрациях.
Тестирование продуктов на наличие ГМО. С точностью до тысячных долей процента позволяет оценить количество генетически модифицированных ингредиентов в продуктах питания, сырье кормах.
Видео о цифровой ПЦР c использованием системы QX100 и ПО ddPCR
Этапы проведения эксперимента при использовании метода цифровой ПЦР.
Капельная цифровая ПЦР осуществляется в четыре последовательных этапа:
Подготовка реакционной смеси. Подготавливают 20 мкл реакционной ПЦР смеси для каждого образца, затем смесь помещают в пластиковый картридж QX200 droplet генератора.
Генерация капель. В соответствующие каналы картриджа заливается специальное минеральное масло, и наполненный картридж устанавливают в QX200 droplet генератор, где образцы и масло соединяются между собой по микро каналам внутри картриджа для получения эмульсии — около 20 000 монодисперсных капель для каждого из 8 подготовленных образцов. Объем каждой капли 1 нл.
Полимеразная цепная реакция. Эмульсионные образцы переносятся на стандартную 96-луночную плашку для ПЦР и амплифицируются с помощью стандартного термоциклера, например C1000 touch.
Считывание и анализ результатов. После завершения ПЦР плашка загружается в QX200 droplet ридер, который обеспечивает анализ флуоресцентного сигнала капель, детектируя каждую каплю по очереди и определяя, какие капли содержат мишень, а какие нет. Анализ результатов осуществляется с помощью программного обеспечения ddPCR.
В клетке могут встречаться редкие мутации, например, лишь в одной из нескольких сотен клеточных митохондриальных ДНК. В общей смеси при обычном ПЦР при таком сильном разведении эти мутации невозможно обнаружить. Похожая картина нередко наблюдается в отношении минорных опухолевых мутациях. Цифровой капельный ПЦР (Droplet Digital PCR) – усовершенствованный метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), при котором реакционная смесь после добавления ДНК распыляется на множество мельчайших капель, попадающих на лунки чипа. Чип может содержать несколько десятков тысяч ячеек, на которых в каплях протекает ПЦР. При этом возможна визуализация результата реакции с каждой ячейки. По завершению реакции данный чип может быть использован для проведения секвенирования или клонирования с каждой капли.
Инновационная система QX200 Droplet AutoDG Digital PCR предназначена для проведения цифровой капельной ПЦР третьего поколения, позволяющей добиться высочайшей точности и достоверности результатов. Система включает в себя автоматический Droplet Generator (генератор микродисперсионных капель из кДНК или РНК-содержащих образцов) со встроенным цветным монитором, QX200 Droplet Reader (позволяет осуществлять сверхчувствительный и точный автоматический анализ продуктов амплификации) и Automated Droplet Generator, который автоматической загрузки образцов и дальнейшее его пипетирование на 96 луночный планшет в генераторе капель. Аппарат AutoDG имеет свой собственный кожух и фильтр НЕРА, что ведет к снижению вероятности загрязнения, поэтому система может быть использована на стандартном лабораторном столе, без необходимости применения бокса для ПЦР или чистой комнаты.
Преимущества цифрового капельного ПЦР по сравнению с RТ ПЦР:
исключительная чувствительность;
исключительная точность;
отсутствие калибровочных кривых;
прямое обнаружение редкого варианта мишени в сложном окружении;
отсутствие эффекта первых циклов ПЦР;
большая производительность;
ручная работа предельно упрощена и сведена к минимуму;
генерация капель для 96 образцов за 45 минут;
HEPA-фильтры для снижения риска контаминации;
цветной сенсорный экран с удобным программным обеспечением.
Количественная оценка биомаркеров рака. Мутациям, ассоциированным с онкологией, часто удаётся избежать детектирования из-за их низкой концентрации по сравнению с фоновой ДНК дикого типа в том же образце. За счёт высокой чувствительности система QX200 позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001% (!) - одна на сто тысяч.
Обнаружение и оценка возбудителей заболеваний. Точная количественная оценка вирусной нагрузки крайне важна для определения состояния заболевания, разработки, утверждения и оценки эффективности терапии. QX200 обладает чувствительностью достаточной для обнаружения сверхмалых количеств вирусного генетического материала и в том числе и в сложных смесях
Определение количества копий гена (CNV). Вариации числа копий гена (CNV) является значимым источником полиморфизма в геноме человека. CNV ассоциируется с раком, неврологическими и аутоиммунными заболеваниями, а также с побочными эффектами при воздействии лекарственных средств. QX200 позволяет определить CNV с точностью соотношения 1.2х (!), например, пять против шести.
Валидация и количественная оценка библиотек NGS. С помощью технологии цифровой ПЦР можно качественно и количественно оценить библиотеку, что позволяет наиболее эффективно использовать секвенаторы.
Анализ экспрессии генов. Капельная цифровая ПЦР позволяет количественно определить уровень экспрессии гена. Благодаря высокой точности и чувствительности метода возможна оценка минимального 10% (!) изменения экспрессии, в том числе и при низких концентрациях.
Тестирование продуктов на наличие ГМО. С точностью до тысячных долей процента позволяет оценить количество генетически модифицированных ингредиентов в продуктах питания, сырье кормах.
Этапы проведения эксперимента при использовании метода цифровой ПЦР.
Капельная цифровая ПЦР осуществляется в четыре последовательных этапа:
Подготовка реакционной смеси. Подготавливают 20 мкл реакционной ПЦР смеси для каждого образца, затем смесь помещают в пластиковый картридж QX200 droplet генератора.
Генерация капель. В соответствующие каналы картриджа заливается специальное минеральное масло, и наполненный картридж устанавливают в QX200 droplet генератор, где образцы и масло соединяются между собой по микро каналам внутри картриджа для получения эмульсии — около 20 000 монодисперсных капель для каждого из 8 подготовленных образцов. Объем каждой капли 1 нл.
Полимеразная цепная реакция. Эмульсионные образцы переносятся на стандартную 96-луночную плашку для ПЦР и амплифицируются с помощью стандартного термоциклера, например C1000 touch.
Считывание и анализ результатов. После завершения ПЦР плашка загружается в QX200 droplet ридер, который обеспечивает анализ флуоресцентного сигнала капель, детектируя каждую каплю по очереди и определяя, какие капли содержат мишень, а какие нет. Анализ результатов осуществляется с помощью программного обеспечения ddPCR.
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
По запросу
По запросу
Количество капилляров в блоке — 8;
лазерный источник света;
длина волны, нм — 505;
количество детектируемых мишеней — 6;
формат планшет — 96 или 384 лунки;
производительность за запуск, п.н. – 3,2 - 8,0 × 10³;
система контроля и оптимизации расхода полимера;
кассеты с РОР полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
на 96 образцов (12 инъекций);
на 384 образца (60 инъекций);
на 960 образов (120 инъекций);
обязательное подключение к ПК;
расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
мощность (без компьютера), Вт — 271;
габариты, Ш × Г × В, мм — 610 × 610 × 720;
вес, кг — 82.
Комплект поставки:генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.
Программное обеспечение:
Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
По запросу
По запросу
Количество капилляров в блоке — 24;
лазерный источник света;
длина волны, нм — 505;
количество детектируемых мишеней — 6;
формат планшет — 96 или 384 лунки;
производительность за запуск, п.н. — 9,6 - 24,0 × 10³;
система контроля и оптимизации расхода полимера;
пакеты с РОР-полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
на 96 образцов (5 инъекций);
на 384 образца (20 инъекций);
на 960 образов (50 инъекций);
обязательное подключение к ПК;
расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
мощность (без компьютера), Вт — 271;
габариты, Ш × Г × В, мм — 610 × 610 × 720;
вес, кг — 82.
Комплект поставки:генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.
Программное обеспечение:
Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
По запросу
По запросу
Формат термоблока — 96 луночный;
источник возбуждения — вольфрамово-галогеновая лампа;
детектор флуоресценции — ПЗС-матрица;
количество каналов измерения флуоресценции — 5;
длины волн возбуждения/флуоресценции, нм — 400 —700;
термоблок — элемент Пельтье;
диапазон температур, °С — 4–100;
гомогенность температур не более, °С — ±0,5;
точность поддержания температуры, °С — ±0,25;
скорость нагрева/охлаждения, °С/сек — 2,5/2,5;
продолжительность ПЦР, ч — 2;
реакционный объем, мкл — 20–100;
поставляется с ноутбуком;
габариты, ШхГхВ, мм — 340х450х490;
вес, кг — 34.
Пять фильтров для работы в широком диапазоне флуорофоров: Fam/Sybr Green I, Vic/Joe, Tamra/Ned/Cy3, Rox/Texas Red, Cy5; возможность количественной оценки патогенов, определения генной экспрессии, анализа однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), качественных исследований с применением внутреннего положительного контроля; система может быть доукомплектована для работы в режиме скоростного термоциклирования, до 7500 Fast.
длина волны возбуждения, нм — 475–495, 515–545, 530–560, 560–590, 615–645;
длина волны флуоресценции, нм — 515–545, 565–585, 575–595, 610–640, 670–700;
исполнительное устройство термоблока — элемент Пельтье;
диапазон температур, °С — 4–100;
гомогенность температур, °C — ± 0,5;
точность поддержания температуры, °C — ±0,25;
скорость нагрева/ охлаждения, °C/с — 4,6/4,6;
реакционный объем, мкл — 10–40;
продолжительность ПЦР, мин — 40;
сенсорный дисплей;
поставляется с ноутбуком;
габариты, Ш х Г х В, мм — 246 х 427 х 512;
масса, кг — 23,6.
Возможность работы с красителями: Fam/Sybr Green, Vic/Joe и Rox. Количественная оценка, определение генной экспрессии, анализ однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), качественных исследований с применением внутреннего положительного контроля; режим скоростной амплификации; дистанционное управление; e-mail — клиент; ПО QuickStart; система самодиагностики, может быть модернизирован до StepOne Plus.
Для повышения удобства работы с сайтом на нем используются файлы cookie.
В cookie содержатся данные о Ваших прошлых посещениях сайта. Если Вы не хотите, чтобы эти данные
обрабатывались, отключите cookie в настройках браузера.