Технологии транскриптомного анализа. Надежно и доступно!

17.11.2019
Lexogen предлагает продукцию для различных методов анализа РНК: наборы для полнотранскриптомного секвенирования, построения экспрессионного профиля, амплификации полноразмерных кДНК, выделения РНК, обогащения фракции мРНК и удаления фракции рибосомальной РНК, а также ПО для обработки результатов секвенирования РНК. Наборы Lexogen отличаются отменным качеством и доступными ценами. Наборы стандартов РНК — уникальны и рекомендованы производителями секвенаторов для валидации результатов секвенирования РНК. lexogen-300x84.jpg



Высокопроизводительное метаболическое секвенирование SLAMseq

SLAMseq — это высокочувствителльный метод для анализа изменений вновь ситезированной и существующей РНК в культуре клеток во времени. SLAMseq позволяет делать анализ синтеза РНК и кинетику.

  • Анализ транскриптомной кинетики синтеза и оборота РНК;
  • измерение зарождающейся экспрессии РНК и стабильности транскрипта;
  • для повышения временного разрешения дифференциальной экспрессии;
  • для определения первичных и вторичных транскрипционных мишеней;
  • не требуется разбавления или биохимического выделения;
  • экономически выгодно и высокопроизводительно при использовании с QuantSeq 3’ mRNA-Seq;
  • SLAMdunk — автоматизированный и удобный анализ данных SLAMseq-QuantSeq.
Пока нет данных. Перейти в каталог
063.02
063.02
0-2 GB
По запросу
По запросу
063.06
0-6 GB
По запросу
По запросу
063.12
0-12 GB
По запросу
По запросу
063.25
0-25 GB
По запросу
По запросу
062.24
24 образца
По запросу
По запросу
061.24
24 образца
По запросу
По запросу
060.24
24 образца
По запросу
По запросу
059.24
24 образца
По запросу
По запросу

Подготовка РНК библиотек для покрытия всей длины транскрипта РНК CORALL Total RNA-Seq Library Prep Kit

  • Полное покрытие транскриптов от начала до конца;
  • подготовка библиотек за 4,5 часа;
  • уникальные молекулярные идентификаторы (UMI) последовательно включены;
  • протокол обладает превосходной стрэнд-специфичностью (>99%);
  • требуется от 1 нг до 1 мг общей РНК на входе;
  • простой протокол «все в одном».
Пока нет данных. Перейти в каталог
096.04
096.04
4 образца
По запросу
По запросу
096.24
24 образца
По запросу
По запросу
096.96
96 образцов
По запросу
По запросу
095.24
095.24
24 образца
По запросу
По запросу
095.96
96 образцов
По запросу
По запросу
Подготовка библиотек при построении экспрессионного профиля с помощью NGS QuantSeq 3’ mRNA-Seq FWD для Illumina

Набор для анализа экспрессии генов на уровне всего генома.

  • Выгодная альтернатива микрочипам и стандартным наборам для секвенирования РНК;
  • высокая воспроизводимость и чувствительность позволяют определять транскрипты с низким уровнем представленности;
  • для анализа достаточно 100 пг суммарной РНК (в т.ч. из гистологических препаратов, фикисрованных в формалине);
  • бесплатный анализ данных на платформе Bluebee genomics analysis (код доступа к платформе на облаке включён в каждый набор);
  • выгодное секвенирование методом одиночных прочтений до 9,216 образцов на одной дорожке секвинатора с помощью 96 i7 x 96 i5 уникальных баркодов;
  • уникальные молекулярные идентификаторы UMI есть в наличии;
  • техподдержка на всех этапах эксперимента — от подготовки библиотек до анализа полученных данных.
Пока нет данных. Перейти в каталог
015.24
015.24
24 образца
По запросу
По запросу
015.96
96 образцов
По запросу
По запросу
015.2x96
2x96 образцов
По запросу
По запросу
015.384
384 образца
По запросу
По запросу
  • Анализ экспрессии всего спектра генов;
  • выгодная альтернатива РНК-микрочипам и стандартному РНК-секвенированию;
  • требуемое количество РНК — от 100 пг;
  • можно использовать на деградированной РНК (например, из FFPE-образцов);
  • методика включает стадию удаления глобиновой мРНК;
  • анализ данных осуществляется на платформе Bluebee genomics с бесплатным доступом;
  • можно секвенировать одновременно до 9216 образцов по методу одиночных прочтений;
  • для мультиплексирования доступны парное индексирование и уникальные молекулярные идентификаторы.


Наборы QuantSeq 3’ mRNA-Seq предназначены для получения Illumina-совместимых библиотек из поли-А РНК. Протокол занимает около 4,5 часов.


Особенность методики — получение только одного фрагмента с одного транскрипта, что даёт возможность оценить уровень экспрессии с высокой точностью. При этом секвенируются последовательности в непосредственной близости от 3’-конца мРНК.


Наборы QuantSeq доступны как для транскриптов с прямой цепи (FWD), так и для обратной цепи (REV). Обе версии обеспечивают высокую специфичность по отношению к направлению цепи.


В состав набора QuantSeq FWD входит праймер для синтеза второй цепи, содержащий линкерную последовательность Read 1. Эта последовательность обеспечивает генерацию ридов при секвенировании в направлении 3’-конца, т.е. соответствующих прямой последовательности мРНК. Более длинные риды дают более полную последовательность 3’-концов.

Не рекомендуется секвенировать библиотеки QuantSeq FWD по методу парных прочтений (paired-end), так как линкерная последовательность Read 2 начинается с поли-Т, а гомополимеры снижают качество ридов.


В состав набора входят магнитные частицы для очистки библиотек, что делает возможным автоматизацию процесса.

Мультиплексирование до 96 образцов обеспечивается с помощью индексов i7, входящих в набор. Дополнительно можно использовать набор индекcов i5 (каталожный номер 047), в итоге можно объединить в библиотеке до 9216 образцов. В набор QuantSeq 3‘ mRNA-Seq Library Prep Kit (FWD) HT кроме i7, включены индексы i5 (5001-5004).

В качестве стартового материала используется суммарная РНК, обогащение полиА-транскриптами происходит за счёт олиго-дТ праймеров.

Подготовка библиотек при построении экспрессионного профиля с помощью NGS QuantSeq 3’ mRNA-Seq FWD для Ion Torrent

Набор для анализа экспрессии генов на уровне всего генома и 3’-нетранслируемых областей.

  • Требуется от 5 нг общей РНК, включая образцы РНК низкого качества и FFPE;
  • экономичное секвенирование до 48 образцов / прогон;
  • 3’ мРНК-Seq библиотеки за 4,5 часа.
Пока нет данных. Перейти в каталог
012.24B
24 образца
По запросу
По запросу
Набор предназначен для получения библиотек, содержащих 3’-концевые последовательности полиА+мРНК, для секвенирования на платформе Ion Torrent. При этом риды генерируются в направлении 3’-концов, отражая истинную последовательность мРНК.

Для получения библиотеки достаточно 5 нг суммарной РНК, в том числе деградированной (например, из FFPE-образцов). Специфичность цепи при секвенировании составляет не менее 99.9%, что позволяет картировать риды на соответствующую цепь геномной ДНК. Это позволяет выявлять антисмысловые транскрипты и перекрывающиеся гены. Процесс получения библиотеки занимает около 4.5 часов.

Поскольку каждый транскрипт даёт только один фрагмент, не требуется нормализация по длине. Это позволяет количественно анализировать экспрессию генов с высокой точностью.

Для получения мультиплексных библиотек в состав наборов входит 24 баркода (набор А или набор В). Таким образом, в одну библиотеку можно загрузить до 48 образцов.
012.24A
24 образца
По запросу
По запросу
Набор предназначен для получения библиотек, содержащих 3’-концевые последовательности полиА+мРНК, для секвенирования на платформе Ion Torrent. При этом риды генерируются в направлении 3’-концов, отражая истинную последовательность мРНК.

Для получения библиотеки достаточно 5 нг суммарной РНК, в том числе деградированной (например, из FFPE-образцов). Специфичность цепи при секвенировании составляет не менее 99.9%, что позволяет картировать риды на соответствующую цепь геномной ДНК. Это позволяет выявлять антисмысловые транскрипты и перекрывающиеся гены. Процесс получения библиотеки занимает около 4.5 часов.

Поскольку каждый транскрипт даёт только один фрагмент, не требуется нормализация по длине. Это позволяет количественно анализировать экспрессию генов с высокой точностью.

Для получения мультиплексных библиотек в состав наборов входит 24 баркода (набор А или набор В). Таким образом, в одну библиотеку можно загрузить до 48 образцов.
Подготовка библиотек при построении экспрессионного профиля и анализа 3’-нетранслируемых областей QuantSeq 3’ mRNA-Seq REV для Illumina

Анализ 3’-нетранслируемых областей и исследование альтернативного полиаденилирования.

  • Достаточно 10 нг суммарной РНК (в т.ч. из гистологических препаратов, фикисрованных в формалине);
  • бесплатный анализ данных на платформе Bluebee genomics analysis (код доступа к платформе на облаке включён в каждый набор;
  • выгодное секвенирование до 9 216 образцов на одной дорожке (методом одиночных или парных прочтений) секвинатора с помощью 96 i7 x 96 i5 уникальных баркодов.
Пока нет данных. Перейти в каталог
016.24
016.24
24 образца
По запросу
По запросу
016.96
96 образцов
По запросу
По запросу
016.2x96
2x96 образцов
По запросу
По запросу
  • Анализ 3’-нетранслируемых областей и исследование альтернативного полиаденилирования;
  • требуемое количество РНК — от 10 нг;
  • можно использовать на деградированной РНК (например, из FFPE-образцов);
  • методика включает стадию удаления глобиновой мРНК;
  • анализ данных осуществляется на платформе Bluebee genomics с бесплатным доступом;
  • можно секвенировать одновременно до 9216 образцов по методу одиночных прочтений.

Наборы QuantSeq 3’ mRNA-Seq предназначены для получения Illumina-совместимых библиотек из поли-А РНК. Протокол занимает около 4,5 часов.

Особенность методики — получение только одного фрагмента с одного транскрипта, что даёт возможность оценить уровень экспрессии с высокой точностью. При этом секвенируются последовательности в непосредственной близости от 3’-конца мРНК.

Наборы QuantSeq доступны как для транскриптов с прямой цепи (FWD), так и для обратной цепи (REV). Обе версии обеспечивают высокую специфичность по отношению к направлению цепи.

В состав набора QuantSeq REV входит олиго-дТ праймер, вводящий линкерную последовательность Read 1 в состав синтезируемой цепи. Этой последовательности комплементарен праймер CSP (Custom Sequencing Primer), входящий в набор и дающий последовательность, соответствующую кДНК. Библиотеки, полученные с помощью QuantSeq REV, можно секвенировать по методу парных прочтений (paired-end).

В состав набора входят магнитные частицы для очистки библиотек, что делает возможным автоматизацию процесса.

Мультиплексирование до 96 образцов обеспечивается с помощью индексов i7, входящих в набор. Дополнительно можно использовать набор индекcов i5 (каталожный номер 047), в итоге можно объединить в библиотеке до 9216 образцов.

В качестве стартового материала используется суммарная РНК, обогащение полиА-транскриптами происходит за счёт олиго-дТ праймеров.
Таргетное секвенирование РНК QuantSeq-Flex V2 для Illumina

Многофункциональный набор для таргетного секвенирования и молекулярного бар-кодирования.

  • Идентификация известных и неизвестных гибридных транскриптов;
  • возможность применения пользовательских праймеров, специфичных к интересующим генам, для синтеза первой и/или второй цепи кДНК;
  • выгодная и гибкая альтернатива готовым панелям для секвенирования;
  • выгодное секвенирование до 9216 образцов на одной дорожке (методом одиночных или парных прочтений) секвенатора с помощью 96 i7 x 96 i5 уникальных баркодов.
Пока нет данных. Перейти в каталог
035.24
035.24
24 образца
По запросу
По запросу
035.96
96 образцов
По запросу
По запросу
034.24
034.24
24 образца
По запросу
По запросу
034.96
96 образцов
По запросу
По запросу
033.24
033.24
24 образца
По запросу
По запросу
033.96
96 образцов
По запросу
По запросу

Подготовка стандартных РНК библиотек для покрытия всей длины мРНК SENSE mRNA-Seq

Набор включает все необходимые компоненты, в т.ч. для селекции поли(А)-РНК, очистки и бар-кодирования.

  • Специфичность определения транскриптов с обеих цепей ДНК > 99,9%;
  • методика, не требующая фрагментации;
  • получение готовой к секвенированию библиотеки занимает не более 5 часов;
  • достаточно 1 нг суммарной РНК;
  • уникальная двойная индексация до 9 216 образцов.
Пока нет данных. Перейти в каталог
007.08В
007.08В
8 библиотек
По запросу
По запросу
007.24В
24 библиотеки
По запросу
По запросу
Наборы SENSE mRNA-Seq Barcode Kit for Ion Torrent предназначены для мультиплексирования при получении библиотек с помощью наборов SENSE для РНК-секвенирования на платформе Ion Torrent.

В каждый набор входит 12 баркодов, позволяющих объединять в библиотеку до 8 или 24 образцов. Пришивка баркодов происходит на стадии обратной транскрипции-лигирования. Баркоды представляют собой 17-нуклеотидные последовательности на 5’-концах ридов; 9 уникальных нуклеотидов фланкированы справа и слева константными 4-нуклеотидными структурами (TCAG-баркод-CGAT).
007.08A
007.08A
8 библиотек
По запросу
По запросу
007.24A
24 библиотеки
По запросу
По запросу
Наборы SENSE mRNA-Seq Barcode Kit for Ion Torrent предназначены для мультиплексирования при получении библиотек с помощью наборов SENSE для РНК-секвенирования на платформе Ion Torrent.

В каждый набор входит 12 баркодов, позволяющих объединять в библиотеку до 8 или 24 образцов. Пришивка баркодов происходит на стадии обратной транскрипции-лигирования. Баркоды представляют собой 17-нуклеотидные последовательности на 5’-концах ридов; 9 уникальных нуклеотидов фланкированы справа и слева константными 4-нуклеотидными структурами (TCAG-баркод-CGAT).
006.08
006.08
8 образцов
По запросу
По запросу
006.24
24 образца
По запросу
По запросу
Набор для приготовления библиотек для секвенирования определённой (+ или -) цепи мРНК, включающий все необходимые компоненты.

Эти библиотеки предназначены для следующих задач:
  • построение точного экспрессионного профиля;
  • секвенирование транскриптома;
  • выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
Исходным материалом для получения библиотек является суммарная РНК. С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования на платформе Ion Torrent (аналогичный набор предлагается для платформы Illumina). Предусмотрена возможность мультиплексирования – могут использоваться инлайн-баркоды (Cat. No. 007.08 и 007.24), позволяющие объединять в одну библиотеку до 24 образцов.

В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
  • набор реагентов для получения библиотеки;
  • комплект для обогащения мРНК Poly(A) RNA Selection Kit;
  • набор буферов и колонок для очистки РНК;
  • дополнительные реагенты не требуются.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов.

Входящий в набор Poly(A) RNA Selection Kit (его можно также приобрести отдельно) обеспечивает эффективную элиминацию рибосомальной РНК. Доля ридов рРНК составляет не более 0.001%.
001.24
001.24
24 образца
По запросу
По запросу
001.96
96 образцов
По запросу
По запросу
Набор для приготовления библиотек для секвенирования определённой (+ или -) цепи мРНК, включающий все необходимые компоненты.

Эти библиотеки предназначены для следующих задач:
  • построение точного экспрессионного профиля;
  • секвенирование транскриптома;
  • выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования на платформе Illumina (также имеется аналогичный набор для Ion Torrent). Исходным материалом для получения библиотек является суммарная РНК. В состав набора входят индексы i7 (7001-7096) для бар-кодирования, а также предусмотрена возможность использования четырёх внешних индексов i5 (Dual Indexing Add-on Kit, Cat. No. 047). Это позволяет объединять до 384 образцов в одну библиотеку. Всего доступно 9216 комбинаций для секвенирования на платформе Illumina.
В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
  • набор реагентов для получения библиотеки;
  • комплект для обогащения мРНК Poly(A) RNA Selection Kit;
  • набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
  • набор с магнитными частицами для очистки РНК;
  • дополнительные реагенты не требуются.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов.

Входящий в набор Poly(A) RNA Selection Kit (его можно также приобрести отдельно) обеспечивает эффективную элиминацию рибосомальной РНК. Доля ридов рРНК составляет не более 0.001%.

Подготовка библиотек для секвенирования коротких РНК Small RNA-Seq Library Prep

Удобный протокол, в котором РНК не нужно очищать с помощью электрофореза в геле:

  • готовые для секвенирования библиотеки всего за 5 часов;
  • широкий диапазон количества исходного материала — от 50 пг до 1 мг РНК;
  • оптимизирован для образцов с низким содержанием РНК, таких, как плазма или сыворотка;
  • 8, 24 или 96 уникальных баркодов в наборе.
Пока нет данных. Перейти в каталог
058.08
058.08
8 образцов
По запросу
По запросу
058.24
24 образца
По запросу
По запросу
058.96
96 образцов
По запросу
По запросу
052.08
052.08
8 образцов
По запросу
По запросу
052.24
24 образца
По запросу
По запросу
052.96
96 образцов
По запросу
По запросу

Удаление рибосомальной РНК RiboCop rRNA Depletion Kit V1.2

Набор позволяет эффективно элиминировать из препарата РНК фракцию рибосомальной РНК; для биологических материалов различных организмов (человек, мышь, крыса), а также для деградированной РНК или РНК из гистологических препаратов.

  • Простая методика без ферментативных реакций;
  • полученный образец РНК пригоден для последующей подготовки NGS-библиотек;
  • количество стартового материала - от 1 нг суммарной РНК.
Пока нет данных. Перейти в каталог
037.24
037.24
24 образца
По запросу
По запросу
037.96
96 образцов
транспортировка +4°C
По запросу
По запросу

Обогащение препарата РНК поли(А)-фракцией Poly (A) RNA Selection — RNA Enrichment Kit

Набор обеспечивает специфическое выделение поли(А) РНК.

  • Быстрая процедура на основе магнитных частиц и простое масштабирование протокола выделения;
  • полученный препарат РНК пригоден для любых экспериментов, в том числе для секвенирования.
Пока нет данных. Перейти в каталог
039.100
100 образцов
173 115
173 115 AMD

Амплификация полноразмерных кДНК TeloPrime Full-Length cDNA Amplification Kit V2

Набор для получения кДНК для построения библиотек для длинноридового секвенирования (в т.ч. для PacBio и Oxford Nanopore Technologies), зондов, RACE (быстрая амплификация концов кДНК) и клонирования.

  • Для амплификации полноразмерных кДНК или специфичных областей кДНК;
  • исключительная специфичность к 5’-кэп- структурам;
  • количество РНК-матрицы — 1 нг–2 мкг.
Пока нет данных. Перейти в каталог
013.08
013.08
8 образцов
По запросу
По запросу
013.24
24 образца
По запросу
По запросу
В основе набора — разработанная компанией «Лексоген» технология лигирования специфических линкеров к кэпированному 5’-концу мРНК, (Cap-Dependent Linker Ligation, CDLL) в сочетании с обратной транскрипцией длинных последовательностей. Эта технология обеспечивает высокую селективность в отношении полноразмерных мРНК, которые обладают как кэпированным 5’-концом, так и полиаденилированным 3’-концом. Использование наборов TeloPrime обеспечивает полную представленность транскриптома и возможность длинных прочтений при его секвенировании.

Особенности наборов TeloPrime:

  • высокая специфичность по отношению к 5’-кэпам и 3’-полиА;
  • Новое! оптимизированы синтез второй цепи кДНК и её амплификация для преимущественного синтеза длинных кДНК (> 2 кб);
  • набор идеален для секвенирования по технологии Oxford Nanopore, дающей длинные риды;
  • все стадии — в одном протоколе;
  • требуемое исходное количество РНК минимально — от 1 нг до 2 мкг;
  • гибкий протокол предусматривает возможность использования пользовательских праймеров для обратной транскрипции.

Области применения наборов TeloPrime:

  • подготовка библиотек для секвенирования по технологии NGS и Oxford Nanopore;
  • RACE — быстрая амплификация концов кДНК;
  • получение РНК-проб;
  • получение кДНК для клонирования.


Протокол включает в себя следующие стадии:

  • синтез первой цепи кДНК путём обратной транскрипции с олиго(дТ) праймером;
  • лигирование специфического олигонуклеотидного дуплекса с 5’-концом полноразмерных дуплексов мРНК-кДНК;
  • синтез второй цепи кДНК;
  • амплификация двухцепочечной кДНК с праймерами, комплементарными концевым структурам полноразмерных кДНК.


В состав набора входят все необходимые реагенты и колонки для очистки продуктов реакций.
Реагенты для ПЦР также можно приобрести отдельно в виде TeloPrime PCR Add-on Kit V2.

Наборы TeloPrime обеспечивают более высокую точность при идентификации сайта начала транскрипции по сравнению с другими методиками синтеза кДНК — переключением цепи или использованием кэпирующих олигонуклеотидов.

Набор для выделения РНК SPLIT-RNA Extraction Kit

Набор для выделения высококачественной РНК (суммарной РНК или отдельных фракций длинных и коротких РНК) для дальнейших экспериментов, где качество РНК является важным параметром.

  • Не требуется ДНКазная обработка, которая может вызвать деградацию РНК;
  • нет загрязнения препарата геномной ДНК.
Пока нет данных. Перейти в каталог
008.48
48 выделений
По запросу
По запросу
Набор SPLIT RNA Extraction Kit предназначен для быстрого и эффективного выделения РНК, свободной от контаминации геномной ДНК. Выделение РНК производится из животных тканей или клеток. РНК может быть выделена как в виде суммарной РНК, так и в виде двух фракций — больших РНК (более 150 нуклеотидов) и малых РНК (менее 150 нуклеотидов). Это облегчает процедуру анализа мРНК и микроРНК в одном и том же образце.

Содержимое набора позволяет выделить суммарную РНК или фракцию больших РНК из 48 образцов. Если в дополнение к фракции больших РНК надо выделить фракцию малых РНК — набора хватает на 24 образца.

В состав набора входят буферные растворы, спин-колонки для сорбции РНК с диоксидом кремния и специальные колонки phase-lock для разделения водной и органической фазы.

Процесс выделения РНК начинается с гомогенизации образца в лизирующем буфере, содержащем кислый фенол. Затем образцы переносятся в колонки phase-lock, центрифугируются, и к водной фазе добавляется изопропанол. Объём изопропанола зависит от того, какая фракция РНК выделяется. РНК сорбируется на диоксид-кремниевой мембране спин-колонок и элюируется в виде чистого препарата.

Контрольные синтетические РНК SIRV-set 3 Mix E0 with ERCCs

  • 69 SIRV изоформ транскриптов семи генов и 92 ERCC последовательности с одной изоформой;
  • детекция РНК в широком динамическом диапазоне концентраций — до 10⁶;
  • удобная дозировка – транскрипты предварительно смешаны и разделены на аликвоты.
Пока нет данных. Перейти в каталог
051.01
051.01
1 пробирка
По запросу
По запросу
051.03
3 пробирки
По запросу
По запросу
Набор для приготовления цепь-специфичных библиотек для секвенирования РНК, включающий все необходимые компоненты. Библиотеки предназначены для следующих задач:
  • построение точного экспрессионного профиля;
  • секвенирование транскриптома;
  • выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов. Специфичность при секвенировании достигает 99.9%.

С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования только на платформе Illumina. Исходным материалом для получения библиотек является РНК после удаления рибосомальной РНК или обогащения поли-А+. Для удаления рибосомальной РНК из образца можно использовать RiboCop rRNA Depletion Kit.

Для работы с набором предлагаются два протокола - для интактной РНК и деградированной РНК (например, из FFPЕ-образцов). В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
  • набор реагентов для получения библиотеки;
  • набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
  • набор с магнитными частицами для очистки РНК.
Для мультиплексирования образцов в состав набора включен комплект баркодов Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096). Предусмотрена возможность создания мультиплексной библиотеки, включающей до 384 образцов. Для этого рекомендуется двойное индексирование с помощью набора Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit.

Контрольные синтетические РНК SIRVs-Spike-in RNA Variant Control Mixes (Set 1 и Set 2)

Spike-in РНК предназначены для валидации результатов РНК-секвенирования с точностью на уровне изоформы.

  • 69 транскриптов для альтернативного сплайсинга, промоторных и полиадениновых областей, перекрывающихся генов и антисенс-транскрипции;
  • количественный анализ дифференциальной экспрессии генов на транскрипционном уровне;
  • Set 1 включает 1 пробирку каждого SIRV mixes E0, E1 и E2, которая содержит 69 SIRV изоформ транскриптов в 3-х различных диапазонах концентраций;
  • Set 2 включает 1 или 3 пробирки с SIRV mix E0, которая содержит 69 SIRV изоформ транскриптов в эквимолярной концентрации.
Пока нет данных. Перейти в каталог
050.01
050.01
1 пробирка
По запросу
По запросу
050.03
3 пробирки
По запросу
По запросу
Набор для приготовления цепь-специфичных библиотек для секвенирования РНК, включающий все необходимые компоненты. Библиотеки предназначены для следующих задач:
  • построение точного экспрессионного профиля;
  • секвенирование транскриптома;
  • выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов. Специфичность при секвенировании достигает 99.9%.

С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования только на платформе Illumina. Исходным материалом для получения библиотек является РНК после удаления рибосомальной РНК или обогащения поли-А+. Для удаления рибосомальной РНК из образца можно использовать RiboCop rRNA Depletion Kit.

Для работы с набором предлагаются два протокола - для интактной РНК и деградированной РНК (например, из FFPЕ-образцов). В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
  • набор реагентов для получения библиотеки;
  • набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
  • набор с магнитными частицами для очистки РНК.
Для мультиплексирования образцов в состав набора включен комплект баркодов Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096). Предусмотрена возможность создания мультиплексной библиотеки, включающей до 384 образцов. Для этого рекомендуется двойное индексирование с помощью набора Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit.
025.03
1 пробирка
По запросу
По запросу
Набор для приготовления цепь-специфичных библиотек для секвенирования РНК, включающий все необходимые компоненты. Библиотеки предназначены для следующих задач:
  • построение точного экспрессионного профиля;
  • секвенирование транскриптома;
  • выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов. Специфичность при секвенировании достигает 99.9%.

С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования только на платформе Illumina. Исходным материалом для получения библиотек является РНК после удаления рибосомальной РНК или обогащения поли-А+. Для удаления рибосомальной РНК из образца можно использовать RiboCop rRNA Depletion Kit.

Для работы с набором предлагаются два протокола - для интактной РНК и деградированной РНК (например, из FFPЕ-образцов). В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
  • набор реагентов для получения библиотеки;
  • набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
  • набор с магнитными частицами для очистки РНК.
Для мультиплексирования образцов в состав набора включен комплект баркодов Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096). Предусмотрена возможность создания мультиплексной библиотеки, включающей до 384 образцов. Для этого рекомендуется двойное индексирование с помощью набора Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit.

ПО для анализа данных секвенирования РНК Mix2

  • Точное и быстрое определение концентрации транскриптов;
  • воспроизводимые результаты при разных условиях;
  • точное определение уровня дифференциальной экспрессии;
  • требует небольшого объёма памяти;
  • на основе командной строки.
Пока нет данных. Перейти в каталог
094.03
094.03
1 запуск, 0-3 GB
По запросу
По запросу
094.06
1 запуск, 0-6 GB
По запросу
По запросу
093.03
093.03
1 запуск, 0-3 GB
По запросу
По запросу
093.06
1 запуск, 0-6 GB
По запросу
По запросу
091.24
24 запуска
По запросу
По запросу
090.24
24 запуска
По запросу
По запросу

Все продукты Lexogen на сайте Стар-лаб >>>

Доступны пробники наборов по запросу:

  • Набор для выделения РНК SPLIT RNA Extraction Kit, 3 выд.
  • Набор для амплификации кДНК TeloPrime Full-Length cDNA Amplification Kit V2, 4 обр.
  • Набор для приготовления библиотек РНК QuantSeq 3‘ mRNA-Seq Library Prep Kit (FWD) для секвенирования на платформе Illumina, 4 обр.
  • Набор для приготовления библиотек РНК QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep Kit (REV)для секвенирования на платформе Illumina с Custom Sequencing Primer, 4 обр.
  • Набор для приготовления библиотек РНК CORALL Total RNA-Seq Library Prep Kit, 4 обр.
  • Набор для удаления рибосомальной РНК RiboCop rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) V1.2, 4 обр.


Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!