Системы капиллярного электрофореза Qsep. Фрагментный анализ ДНК и РНК

15.11.2018

Автоматические системы капиллярного электрофореза Qsep, BiOptic сконструированы для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов — в одном приборе в одну стадию!

Скрининг ПЦР-продуктов;
генотипирование;
количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
анализ фрагментированности геномной ДНК;
анализ внеклеточной ДНК;
анализ олигонуклеотидов;
анализ продуктов рестриктазного расщепления;
оценка целостности РНК (RNA Quality Number).

Электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer (в комплекте поставки).

Автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
чувствительность — от 100 пг/мкл;
объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО;
низкая себестоимость анализа (по сравнению с аналогичным оборудованием).

	Qsep1	Qsep100	Qsep400
Тип прибора	портативный	стационарный
Детекция	флуоресцентная
Связь с ПК	wi-fi	USB
Ток разделения	1-8 КВ	1-15 КВ
Картридж	1-капиллярный		4-капиллярный
Автосэмплер	1-12 образцов	1-96 образцов

Картриджи для капиллярного электрофореза Qsep

Электрофорез биомолекул в системах Qsep происходит в специальных картриджах разных типов, предназначенных для разделения ДНК, РНК и белков.

Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов, зависит от типа прибора). В комплект поставки, кроме картриджа, входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10 - 15000 п.н.	10 - 15000 п.н.	10 - 23000 п.н.	10 - 5000 п.н.	10 - 5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4 - 10 п.н.	1 - 4 п.н.	10 - 50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Анализ результатов электрофореза:

отслеживание разделения фрагментов в режиме реального времени;
визуализация фрагментов после разделения в виде геля с окрашенными фрагментами или в виде электрофореграммы;
проведение качественного и количественного анализа фрагментов ДНК;
проведение оценки качества РНК;
получение результатов анализа в виде файлов различных форматов (pdf, Excel, текстовый формат и т.д.).

Пока нет данных. Перейти в каталог

Развернуть все Названия полностью

BiOptic

Система капиллярного электрофореза, автосамплер на 96 образцов, для анализа ДНК, РНК, белков, ПО, насос, маркеры мол. веса, Qsep100

C100100

По запросу

Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.

Особенности системы Qsep100:

автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
чувствительность — от 100 пг/мкл;
объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

Технические характеристики системы Qsep100:

связь с ПК — USB;
источник возбуждения флуоресценции — светодиодный, 525 нм (зелёный);
детекция флуоресценции, нм — 590;
количество капилляров в картридже: 1;
ток разделения, кВ — 1-15;
габариты, Г × В × Ш, см — 38 х 40 х 30.

Области применения Qsep:

скрининг ПЦР-продуктов;
генотипирование;
количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
анализ фрагментированности геномной ДНК;
анализ внеклеточной ДНК;
анализ продуктов рестриктазного расщепления;
анализ олигонуклеотидов;
оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).

Комплект поставки: Qsep100: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.

Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep 100:

Электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Тип анализируемой молекулы	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	10-50000 п.н.	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4-10 п.н.	1-4 п.н.	10-50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Время анализа одного образца	2-3 мин	3-5 мин	5-21 мин	1-2 мин	2-3 мин	5-10 мин
Количество образцов (на 1 картридж)	200	200	200	300	100	100
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Ссылка для скачивания обновлений:

___________________________________________________________________________________________________________________________________________

Примеры анализа результатов электрофореза с помощью Q-Analyzer Количественный и качественный анализ фрагментов ДНК Анализ ДНК с помощью картриджа S1 (High Resolution) — разделение ПЦР-продуктов с разрешением 2-5 п.н. Возможна визуализация фрагментов одинаковой длины, но разного нуклеотидного состава в виде раздельных пиков. Разделение продуктов расщепления плазмиды pBR322 рестриктазой MspI Высокая чувствительность — идентификация коротких фрагментов в низкой концентрации (15 п.н. — 0,056 нг/мкл; 26 п.н. — 0,194 нг/мкл; 34 п.н. — 0,253 п.н.) Высокое разрешение — разделение фрагментов с разницей по длине 4 п.н. (238 и 242 п.н.) Высокое разрешение — разделение фрагментов одинаковой длины (147/147 п.н. и 160/160 п.н.), но разного нуклеотидного состава.
Анализ ДНК в низких концентрациях Выявление внеклеточной ДНК с помощью картриджа N1 (High Sensitivity). Точность измерения сопоставима с таковой на флуориметре Quibit, Thermo Fisher Scientific. Возможна детекция внеклеточной ДНК (фетальной или опухолевой) в плазме крови в концентрации 3-4 нг/мкл.
Оценка степени деградации геномной ДНК и идентификация различных форм плазмидной ДНК
Анализ целостности РНК Критерием целостности РНК является показатель RQN (RNA Quality Number), являющийся аналогом RIN (RNA Integrity Number). Корреляция между RQN и RIN.
Анализ качества NGS-библиотек С помощью ПО Q-Analyzer можно оценить не только концентрацию отдельных фрагментов ДНК, но и суммарную концентрацию ДНК в определённом диапазоне длин, а также распределение длин фрагментов ДНК.
Электрофорез белков в системах Qsep Кроме фрагментного анализа нуклеиновых кислот системы Qsep100 и Qsep400 могут использоваться для электрофореза белков. Белки в образце должны быть предварительно помечены флуоресцентным красителем Chromeo P503 (в случае Qsep100 Advanced возможно также мечение FITC) и денатурированы. Построение белкового профиля c помощью Qsep. С помощью Qsep100 Advanced возможно также разделение пептидов и аминокислот, меченых FITC.