01.04.2020
Современный
капиллярный секвенатор (капиллярный генетический анализатор, секвенатор 1 поколения, классический секвенатор) — автоматический прибор, позволяющий проводить
секвенирование и фрагментный анализ нуклеиновых кислот по методу Сэнгера (см. ниже).
Разделение фрагментов ДНК сейчас в автоматических капиллярных секвенаторах проводится путем капиллярного электрофореза, ранее это делалось в ручную в
плоских гелях с использованием радиоактивной метки.
В капиллярном секвенаторе для анализа используется гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины). Обычно до начала секвенирования производят
амплификацию участков ДНК, последовательность которых требуется определить. В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.
В отличие от капиллярных секвенаторов в
NGS–секвенаторах возможно секвенирование негомогенных проб ("библиотека" молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников).
Подробнее о секвенаторах ДНК по Сэнгеру....
См. также
Секвенирование по Сэнгеру Секвенаторы ДНК 2-го поколения NGS Секвенаторы ДНК 3-го поколения, нанопоровые Секвенаторы пиро ДНК-амплификаторы "в реальном времени" ДНК-амплификаторы "классические" Флуориметры детекторы ПЦР Электрофорез капиллярный на чипе