RNA-seq стало проще с реагентами SEQuoia, Bio-Rad!

Новейшее революционное решение для секвенирования РНК (в том числе малых РНК) представляет компания Bio-Rad, известный производитель реагентов в области геномных исследований.

Для решения данной задачи разработана платформа SEQuoia (набор для создания полнотранскриптомных библиотек SEQuoia Complete Stranded RNA Library Prep Kit и набор для удаления рибосомальной РНК SEQuoia RiboDepletion Kit).

Полный рабочий процесс на платформе SEQuoia

Набор SEQuoia Complete Stranded RNA Library Prep Kit

Этот набор позволяет эффективно захватывать все подтипы РНК для составления единой библиотеки, даже при работе с образцами небольшой массы и невысокого качества.

• Идеален для количественно малых и сложных образцов.
• Валидирован на FFPE образцах и других образцах низкого качества.
• Оптимизированный протокол (время выполнения менее 4 часов).
• Интегрирован с ПО анализа данных SeqSense NGS Data Analysis Software в единую биоинформационную систему.
• Совместим со всеми платформами для секвенирования Illumina.

Для получения оптимальных результатов мультиплексного секвенирования для работы с набором предназначены высококачественные уникальные парные праймеры с двойным индексированием (предлагаются в вариантах на 12 или 96 UDI-праймеров).

Диапазон РНК, захватываемых набором SEQuoia Complete Stranded RNA Library Prep Kit

Рабочий процесс подготовки библиотеки РНК с набором SEQuoia Complete Stranded RNA Library Prep Kit

Набор SEQuoia RiboDepletion Kit

Автономное решение для деплеции рибосомальной РНК после подготовки библиотеки позволяет уменьшить число фрагментов при картировании РНК, сохраняя больше фрагментов в транскриптоме.

• Эффективное удаление фрагментов рибосомальной РНК из библиотеки.
• Идеален для небольшого количества материала и невысокого качества.
• Совместимость с большинством наборов для подготовки библиотек РНК, используемых на платформах для секвенирования Illumina.
• Универсальный протокол позволяет выполнять деплецию РНК из нескольких библиотек в рамках одной реакции.

В наборе SEQuoia RiboDepletion Kit используется запатентованная смесь синтетических биотинилированных олигонуклеотидов, гомологичных кДНК, полученной из цитоплазматической рРНК человека, мыши и крысы (рРНК 5S, 5.8S, 18S и 28S) и мтрРНК (рРНК 12S и 16S). Целевые кДНК, гибридизированные с комплементарными биотинилированными олигонуклеотидами, далее удлиняются в ходе реакции синтеза ДНК. Полученная в результате двухцепочечная ДНК захватывается с использованием парамагнитных микросфер, покрытых стрептавидином, а затем удаляется из библиотеки. Этот технологический процесс может быть выполнен за 2 часа.

Рабочий процесс набора SEQuoia RiboDepletion Kit

Информация для заказа: