Компания Thermo FS – мировой лидер в производстве оборудования и реагентов для молекулярной биологии, а также комплексных решений для выполнения ряда прикладных задач, связанных с анализом генома (генетический анализ).
Данные решения базируются на применении основных молекулярно-генетических методов: полимеразная цепная реакция (ПЦР), секвенирование и микрочиповый анализ (microarray). Спектр решаемых задач охватывает микробиологию, генетику человека, медицину (репродуктивное здоровье, наследственные заболевания, онкология), генетику сельскохозяйственных животных и растений, домашних питомцев (кошки, собаки), исследования транскриптома и пр.
Технология TaqMan представляет собой разновидность ПЦР, в которой кроме двух праймеров используется зонд, комплементарный участку ДНК между праймерами. Данный зонд на 5’-конце несет репортерный флуоресцентный краситель (reporter), а на 3’-конце – гаситель флуоресценции (quencher). Поскольку зонд находится между праймерами, в фазе элонгации ДНК-полимераза гидролизует его, тем самым физически разделяя краситель и гаситель. При последующем возбуждении светом определенной длины волны амплификатор детектирует флуоресценцию красителя. Измерение флуоресценции на каждом цикле ПЦР позволяет прибору строить кривую флуоресценции, тем самым в реальном времени определяя количество целевого продукта (ампликонов).
Применение в технологии TaqMan дополнительного компонента (зонда) значительно увеличило специфичность реакции, а расположение на зонде красителя и гасителя снизило уровень флуоресцентного «шума», а также повысило чувствительность и воспроизводимость реакции ПЦР. На рисунке ниже показано сравнение технологии TaqMan с ранее широко применявшейся SYBR Green в качестве интеркалирующего красителя.
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
||
|
|
На данный момент компания Thermo FS на основе технологии TaqMan разработала более 20 миллионов наборов (assay) для более 30 организмов, которые включают в себя дизайн праймеров, зондов, температурный режим ПЦР и анализ кривой. Также возможен индивидуальный дизайн набора под заказ.
Наборы TaqMan поставляются в четырех форматах: в отдельных пробирках, в предварительно раскапанных 96- и 384-луночных плашках, в 384-микрофлюидных картах и в плашках OpenArray для работы с амплификатором QuantStudio12K Flex.
Отдельные пробирки
|
96- или 384-луночные плашки
|
384-луночные микрофлюидные карты
|
Плашки OpenArray
|
Для таргетного секвенирования компания Thermo FS разработала панели AmpliSeq. Данные панели представляют собой наборы пар праймеров, позволяющих проводить в одной пробирке высокопроизводительную мультиплексную ПЦР, амплифицируя до 20 000 целевых фрагментов (ампликонов). Далее из полученных ампликонов при помощи прибора Ion Chef формируется библиотека фрагментов и производится загрузка чипов. Само секвенирование осуществляется с использованием прибора из линейки Ion GeneStudio S5.
В результате секвенируется не весь геном целиком, а отдельные целевые участки, интересующие исследователя. Данный подход уменьшает объем работы и упрощает анализ полученных данных. Рабочий процесс от выделения ДНК/РНК до анализа результатов секвенирования занимает не более двух суток.
Компания Thermo FS разработала бесплатное ПО Ion AmpliSeq Designer, которое позволяет пользователю самостоятельно редактировать существующие панели и создавать новые.
Для решения задач, связанных с селекцией растений и животных компания Thermo FS разработала панели AgriSeq, которые работают на принципах, аналогичных AmpliSeq. В качестве секвенируемых участков ДНК выбраны те, которые ассоциированы с хозяйственно ценными признаками. Таким образом, полученные ампликоны являются молекулярными маркерами, которые можно использовать для ускорения селекционного процесса.
Как правило, количество анализируемых точечных полиморфизмов (SNP) составляет от 50 до 5 000 на панель. Имеется возможность создания пользовательских панелей (от 2 до 6 недель). Максимальное количество анализируемых образцов (чип Ion 550, 100-x покрытие) – 1 536.
Для работы с секвенаторами illumina Thermo FS производит панели Eureka. Количество SNP на панель несколько меньше, чем у AgriSeq – от 50 до 3 000, а время создания пользовательских панелей больше – от 8 до 12 недель.
Для генотипирования растений и животных применяются микрочипы Axiom. Микрочипы содержат наборы ДНК-зондов (маркеров) из базы данных Axiom Genomic Database или маркеров de novo, в том числе созданных конкретным заказчиком. Микрочип представляет собой твёрдую поверхность, на которую методом фотолитографического синтеза нанесены ДНК-олигонуклеотиды заданной последовательности (зонды). Зонды могут гибридизоваться с комплементарными областями фрагментов ДНК, кДНК или РНК, которые предварительно помечены специальными флуоресцентными красителями.
Микрочипы Axiom представлены планшетами различной плотности: 24-, 96-, mini 96-, 384-матричные форматы. В зависимости от формата на каждой матрице можно анализировать от 50 000 до 750 000 SNP, инсерций, делеций. По желанию заказчика возможно создание микрочипов для одновременного анализа нескольких биологических видов. При этом ни количество видов, ни количество маркеров для каждого вида не ограничены.
Пробоподготовка при работе с микрочипами Axiom (амплификация ДНК, фрагментация, очистка, гибридизация и мечение ДНК) проводится при помощи автоматической станции Nimbus. Детекция результатов гибридизации ДНК с зондами осуществляется с использованием автоматической системы Gene Titan.
A30391_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Система QuantStudio 5 в формате 384-луночного блока позволяет с повышенной точностью и чувствительностью решать задачи, такие как:
Комплект поставки: ДНК-амплификатор, шнур питания, ПО QuantStudio Design and Analysis software, верификационный планшет, инструкции; ноутбук; 2 года гарантии, 1 день тренинга.
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4480621_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Прибор нового поколения для решения широкого спектра задач, для качественного и для количественного анализа: анализ экспрессии генов и микроРНК, SNP генотипирование, HRM анализ, определение мутаций, вирусов, ГМО и др.; возможность интеграции в роботизированную рабочую станцию Applied Biosystems Twister II Robot; прибор с термоблоком OpenArray поставляется с роботизированной станцией Accufill для нанесения образцов на OpenArray-пластины.
В комлект поставки входит: тренинг по технологии OA 2 дня у клиента; набор для калибровки прибора; калибровочная плашка; набор для обучения обращения со слайдом OA; плашка для инсталляции прибора. Программное обеспечение:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A38412_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Серия Ion GeneStudio S5 — это линейка высокоскоростных полупроводниковых настольных систем секвенирования следующего поколения (NGS). Имеется возможность масштабирования производительности на одной платформе, в зависимости от задач исследования, путем выбора одного из пяти чипов Ion Torrent. Возможность автоматической подготовки библиотеки, подготовки шаблона и загрузки чипа с использованием системы Ion Chef.
Производительность и время запуска:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A38409_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Серия Ion GeneStudio S5 — это линейка высокоскоростных полупроводниковых настольных систем секвенирования следующего поколения (NGS). Имеется возможность масштабирования производительности на одной платформе, в зависимости от задач исследования, путем выбора одного из пяти чипов Ion Torrent. Возможность автоматической подготовки библиотеки, подготовки шаблона и загрузки чипа с использованием системы Ion Chef.
Производительность и время запуска:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A38406_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Серия Ion GeneStudio S5 — это линейка высокоскоростных полупроводниковых настольных систем секвенирования следующего поколения (NGS). Имеется возможность масштабирования производительности на одной платформе, в зависимости от задач исследования, путем выбора одного из пяти чипов Ion Torrent. Возможность автоматической подготовки библиотеки, подготовки шаблона и загрузки чипа с использованием системы Ion Chef.
Производительность и время запуска:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A26671_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Комплект поставки: инструмент Ion Chef System, два года гарантии, инсталляционный набор. Скачать материалы pdf: Система Ion Chef, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>> Видео: Система Ion Chef предоставляет свободу, рабочий процесс |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A27766
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SY-410-1003
|
|
|
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
|
По запросу По запросу |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Настольный интегрированный инструмент для NGS, включающий в одном приборе блоки для подготовки образцов (образования кластеров), секвенирования и обработки данных и интерфейс для управления. Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидов и детекцию света флуоресценции от кластеров ДНК.
Основные применения:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A39053_компл
|
|
|
По запросу По запросу |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Система GeneTitan Multi-Channel — автоматическая высокопроизводительная станция для хромосомного микроматричного анализа (ХМА), анализа экспрессии генов, полногеномного SNP генотипирования и анализа микробиома, позволяет параллельно обрабатывать большое количество образцов без присмотра оператора.
Система GeneTitan Multi-Channel обьединяет в себе печь гибридизации, отмывочные станции и устройство визаулизации, что позволяет полностью автоматизировать процесс проведения анализа. Данная система поддерживает 16-, 24-, 96- и 384-луночные микроматричные планшеты, благодаря чему становится возможным единовременное и автоматическое проведение анализа большого количества образцов. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) позволяет обнаружить:
Применения в клинической практике:
Применения в агрогенетике:
Принцип работы: Для проведения ХМА используется твердый носитель небольшого размера (микроматрица) из стекла или кремния. В определенном порядке к нему прикреплены короткие олигонуклеотиды (8-80 н.п.) или фрагменты ДНК (более 100 н.п.). Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 2,7 млн. специфических олигонуклеотидов. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. За счет высокой плотности маркеров можно определить минимальные потери/увеличение генетического материала всех регионов генома. Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов (SNP), анализа копийности любых участков генома (CNV), определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов. Этапы работы Системы GeneTitan Multi-Channel Рабочий процесс, проводимый системой GeneTitan Multi-Channel, включает в себя амплификацию ДНК, далее фрагментацию и гибридизацию ДНК, затем лигирование, отмывку и визуализацию. Анализ полученных данных проводится с помощью бесплатных программ RHAS, MSV, ChAS. GeneTitan Multi-Channel работает без присмотра в течение ночи, обеспечивая в 10 раз большую производительность по сравнению с другими платформами, а уникальная степень автоматизации означает превосходную воспроизводимость и повышенную уверенность в ваших результатах:
Комплектация GeneTitan Multi-Channel:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
A25741-promo
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Готовая 2-кратная смесь для ПЦР в режиме реального времени. Включает в себя все необходимые компоненты, кроме матрицы и праймеров — оптимизированный буфер, Taq ДНК-полимеразу Dual-Lock, термолабильную урацил-ДНК-гликозилазу, дезоксинуклеотидтрифосфаты (включая смесь дТТФ/дУТФ), референсный пассивный краситель ROX и интеркалирующий краситель SYBR Green I для детекции ПЦР-продуктов. Количества мастер-микса достаточно для постановки 1000 реакций по 20 мкл.
Мастер-микс PowerUp SYBR Green совместим с амплификаторами с функцией Real-time следующих производителей:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Как работает TaqMan – спроси TaqMan, Эп. 13, Life Technologies |
Что можно сделать на основе химии Ion AmpliSeq Chemistry? - Seq It Out #8, Thermo FS |
Рабочий процесс | Система Ion Chef обеспечивает свободу прогулок, Thermo FS |
Представляем системы серии Ion GeneStudio S5 для секвенирования нового поколения, Thermo FS |
Вы можете оставить свой запрос здесь:
С помощью личного кабинета Вы сможете: