Коронавирус COVID-19 (SARS-CoV-2): обнаружение и характеризация вакцин, Merck

https://www.sigmaaldrich.com/RU/en/product/sigma/cb_01042712Предлагаем подробный обзор продуктов и услуг компании Merck для исследователей COVID-19. Реактивы для очистки НК, проведения ПЦР, иммунологического анализа, антитела, мультиплексный анализ Milliplex и многое другое.

Обнаружение вирусов

Предлагаем ознакомиться с предлагаемым ассортиментом продуктов для очистки вирусной РНК, проведения ОТ-ПЦР, количественной ОТ-ПЦР, иммунологического анализа, а также вспомогательных реагентов, которые помогут в разработке аналитических методик для диагностики SARS-CoV-2.

Ознакомьтесь с полным обзором решений Merck для разработки диагностических методик иммунологического и молекулярного анализа.

Наборы и реагенты для количественного ПЦР-определения коронавируса 2019-nCoV

Наборы для количественного ПЦР-определения коронавируса 2019-nCoV (SARS-CoV-2), представленные ниже в продуктовой линейке KiCqStart, доступны для заказа уже сейчас.

• Для обнаружения с помощью SYBR Green выберите Праймеры KiCqStart.
• Для обнаружения с помощью зондов выберите Анализы KiCqStart с использованием зондов

Ниже приведён перечень доступных целевых структур для обнаружения

Детектирующая структура	Прямая последовательность	Обратная последовательность	Зонд
SYBR Green 1	GCCTCTTCTCGTTCCTCATCAC	AGCAGCATCACCGCCATTG
SYBR Green 2	AGCCTCTTCTCGTTCCTCATCAC	CCGCCATTGCCAGCCATTC
Двояко-меченый зонд 1	CCGCAAGGTTCTTCTTCGTAAG	TGCTATGTTTAGTGTTCCAGTTTTC	AAGGATCAGTGCCAAGCTCGTCGCC
Двояко-меченый зонд 2	GGCTTACCGCAAGGTTCTTC	TGCTATGTTTAGTGTTCCAGTTTTC	AAGGATCAGTGCCAAGCTCGTCGCC
Двояко-меченый зонд 3	CAGGTATATGCGCTAGTTATCAGAC	CCAAGTGACATAGTGTAGGCAATG	AGACTAATTCTCCTCGGCGGGCACG
Двояко-меченый зонд 4	GCAGGTATATGCGCTAGTTATCAG	ACACTGGTAGAATTTCTGTGGTAAC	AGACTAATTCTCCTCGGCGGGCACG

Ниже приведена структура для положительного контроля при обнаружении SARS (на данный момент методика прошла валидацию in silico)

Детектирующая структура	Прямая последовательность	Обратная последовательность	Зонд
Двояко-меченый зонд	GCTGTGTGTTTGCCTATGTTGG	ACGTTCACGACTCAGTATCTCAAG	AGCGTGCCTACTGGGTTCCTCGTGC

ОТ-ПЦР и количественная ОТ-ПЦР: молекулярный анализ и вспомогательные реагенты

Merck предлагает широкий ассортимент реагентов, наборов и инструментов для проведения ПЦР, способных удовлетворить Ваши потребности на любой стадии разработки методик определения SARS-CoV-2.

• Набор Transcriptor One-Step RT-PCR для проведенияОТ-ПЦР
• Набор Transcriptor One-Step RT-PCR разработан с применением инновационной
• технологии одностадийной полимеразной цепной реакции с
• обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Смесь ферментов, входящая
• в комплект, содержит Taq ДНК-полимеразу и корректирующую
• полимеразу, обеспечивающие высокую чувствительность
• и надёжность результатов обратной транскрипции. Набор
• Transcriptor One-Step RT-PCR содержит все необходимые
• компоненты (за исключением матриц и праймеров) для
• проведения одностадийной ОТ-ПЦР.

• KAPA PROBE FAST One-Step
  Набор KAPA PROBE FAST One-Step разработан для быстрого высокоэффективного одностадийного количественного определения РНК. Набор KAPA PROBE FAST One-Step пригоден для использования в сочетании с любыми флуорогеннымизондами, включая гибридизационные зонды (например, FRET), гидролизуемые зонды (например, TaqMan) и зонды-молекулярные маяки.
  
  
• Система Titan One Tube RT-PCR
  При проведении ПЦР в системе Titan One Tube RT-PCR синтез первой цепочки кДНК осуществляется с помощью обратной транскриптазы вируса миелобластоза птиц (AMV), а последующая амплификация кДНК — с помощью смеси ферментов Expand High Fidelity, в состав которой входят ДНК-полимераза Taq и корректирующая полимераза.
  
  
• Комплект Quantitative RT-PCR ReadyMix для проведения количественной ОТ-ПЦР
  Помимо обратной транскриптазы вируса мышиного лейкоза Молони (M-MLV RT), которая участвует в синтезе первой цепочки кДНК, набор ReadyMix™ для количественной ОТ-ПЦР содержит также растворы ДНК-полимеразы JumpStart Taq DNA, дезоксинуклеотиды 99% чистоты, а также буферные растворы и стабилизаторы, поставляемые в виде растворов двойной концентрации.
  
  
• Комплект KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix для проведения одностадийной количественной ОТ-ПЦР с использованием зондов
  Набор KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix подходит для работы со всеми типами двояко-меченых зондов и содержит все необходимые реагенты (за исключением матриц РНК и зондов) для проведения количественной ОТ-ПЦР. Возможна поставка комплекта KiCqStartOne-Step Probe RTqPCR ReadyMix с референсным красителем ROX или без него.
  
  
• Комплект SYBR Green Quantitative RT-qPCR для количественной ОТ-ПЦР
  Данный набор, сочетающий в себе преимущества обратной транскриптазы вируса мышиного лейкоза Молони (M-MLV RT) и ДНК-полимеразы JumpStart Taq DNA, входящих в состав удобной в работе смеси ReadyMix, позволяет проводить высокочувствительный количественный анализ экспрессии генов.

Описание	№ в каталоге
Transcriptor One-Step RT-PCR Kit	TOSRTRO
KAPA PROBE FAST One-Step	KK4752
Titan One Tube RT-PCR System	11855476001
Quantitative RT-PCR ReadyMix	QR0200
KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix	KCQS07
KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix, Low ROX	KCQS08
KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix, ROX	KCQS09
Nuclease-Free Water, Molecular Grade	W4502
SYBR Green Quantitative RT-qPCR	QR0100
NucleoClean Decontamination Spray (alternative to bleach)	3097S
ViralXress DNA/RNA Extraction Reagent	3095
Nuclease Free Water	3098

Продукты предназначены только для исследовательских целей. Не использовать для диагностики.

Сверхчистая вода

Высокая скорость развития и возрастающее разнообразие исследовательских работ, постоянная смена приоритетов, большое число операторов и ограниченность пространства — все эти факторы стимулируют лаборатории к приобретению универсального, инновационного и удобного в размещении оборудования. Cистема получения сверхчистой воды Milli-Q IQ 7000 с различными финишными фильтрами соответствует всем перечисленным требованиям.

Основные продукты для разработки методик молекулярной диагностики и иммунологического анализа

Антитела для разработки методик серологического анализа. Линейка антител Merck подходит для классификации человеческих иммуноглобулинов (IgG, IgM, IgA), в цельной крови для разработки методик серологического анализа.

Описание	№ в каталоге
Goat Anti-Human IgG Antibody, HRP conjugate	AP112P
Goat Anti-Human IgG Antibody, HRP conjugate	AP309P
Anti-human IgM (μ-chain-specific) HRP	A6907
Anti-human IgA (α-chain-specific) HRP	A0295

Продукты предназначены только для исследовательских целей. Не использовать для диагностики.

Пробумин

Бычий сывороточный альбумин диагностического класса, применяемый в протеазочувствительном иммунологическом анализе и в качестве стабилизирующего агента для реагентов белковой природы, требующих низкого содержания IgG, также применяемый в молекулярной биологии. Чистота продукта превышает 98% и обычно равна 100%.

Описание	Количество в упаковке	№ в каталоге
Probumin Bovine Serum Albumin	1 кг	820452
Probumin Bovine Serum Albumin	5 кг	820456
Probumin Bovine Serum Albumin	100 г	820451

Продукт предназначен для производственных и исследовательских целей. Продукт не предназначен для употребления в пищу человеком или животными. Не использовать для диагностики.

ProClin 300

Биоцид, разработанный для применения на предприятиях, занимающихся производством диагностических продуктов. Данный препарат является эффективной и безопасной для окружающей среды альтернативой для существующих консервантов, применяемых в реагентах для диагностики. При введении в рекомендованных количествах, препарат ProClin не представляет угрозы здоровью, не токсичен и не требует специальных мер по утилизации.

Описание	№ в каталоге
ProClin 300	48912-U

Характеризация вирусов

Разработка эффективных вакцин и лекарственных средств начинается с надёжной характеризации вируса. Здесь собраны сведения о реагентах и лабораторном оборудовании, предназначенных для исследования механизма прикрепления и проникновения вируса в клетку, вирусной геномики и протеомики, иммунного ответа. Представленные продукты обеспечивают безопасность и эффективность работы с вирусами и другими возбудителями.

Механизмы прикрепления и проникновения вируса в клетку

Недавние исследования механизма попадания вируса в клетку показали, что SARS-CoV-2 использует рецепторы ангиотензин-превращающего фермента II (ACE2) для попадания в клетку и сериновую протеазу TMPRSS2 для примирования S-белка. Используйте продукцию Merck для исследования моноклональных и поликлональных антител и низкомолекулярных веществ, специфичных для соответствующих вирусов, а также для исследования рецепторов, используемых вирусами для прикрепления и проникновения в клетки (включая ACE2).

Клеточные культуры для размножения вируса

Ассортимент клеточных культур, применяемых в исследовании механизма прикрепления вируса SARS CoV, его попадания в клетку и размножения, включает в себя клетки Vero, Huh-7D 12 и Caco-2. Все вариант доступны для заказа ниже.

Для получения информации об использовании клеточных культур для размножения вируса прочитайте статью «Использование клеточных культур для культивирования вирусов и производства вакцин».

Описание	№ в каталоге
Vero C1008 African green monkey kidney Cell LIne, Clone E6	85020206-1VL
Vero C1008 cell line [clone E6, Vero E6]	85020206
VeroCCL81 cell line	84113001
VeroCCL81 cell line (animal-component free)	08011101
16HBE14o- Human Bronchial Epithelial Cell Line	SCC150
CACO-2 Human Cell Line	86010202
CACO-2 Cell Line human (intestinal permeability characteristics tested)	09042001
Huh-7D12 Cell Line human (expresses ACE2 receptor)	01042712
293T cell line human	12022001
Human Small Airway Epithelial Cells (HSAEpC) Primary human cells (optimized media also available)	C-12642
Huh-7D 12 cell line, human	01042712-1VL
ACE2 Inhibitor, MLN-4760	5306160001
Angiotensin Converting Enzyme-2, ACE2	SAE0064
Anti SARS Antibody S-Specific Clone 154C	MAB8783
Anti-ACE2 antibody produced in rabbit, Prestige Antibodies (Enhanced Validation) Immunogen: ACE2 PrEST Applications: WB, IHC	HPA000288
Anti-ACE2 antibody produced in rabbit Immunogen: Synthetic peptide directed towards the middle region of human ACE2 Applications: IF, IHC, ELISA, WB	SAB3500346
Anti-ACE2 antibody produced in rabbit Immunogen: Synthetic peptide directed towards the middle region of human ACE2 Applications: WB, IHC	SAB2100025
Anti-ACE2 antibody produced in rabbit Immunogen: Synthetic peptide directed towards the N-terminus of human ACE2 Applications: IF, IHC, ELISA, WB	SAB3500978
Anti-ACE2 antibody produced in rabbit Immunogen: Synthetic peptide directed towards the C-terminus of human ACE2 Applications: IF, IHC, ELISA, WB	SAB3500977
Anti-ACE2 antibody, clone 4G5.1	MABN59
ANTI-BAT1(C-TERMINAL)	SAB1307254
Anti-CD209	SAB1407409
Anti-SARS Antibody, M Specific	MAB8787
Anti-TMPRSS2 antibody produced in rabbit, Prestige Antibodies	HPA035787

Анализ с проведением ОТ-ПЦР

Здесь собраны реагенты и инструменты для исследования генома вируса, включая наборы NAP для очистки вирусной РНК, высокоэффективные системы для ОТ-ПЦР и количественной ОТ-ПЦР, наборы для синтеза кДНК и многое другое. Наборы для одностадийного проведения анализа позволяют упростить и ускорить процедуру амплификации генов в широком динамическом диапазоне.

Описание	№ в каталоге
One Step RT-PCR Master Mix Kit	71978
Transcriptor One-Step RT-PCR Kit	TOSRTRO
Transcriptor High Fidelity cDNA Synthesis Kit	THIFICDNARO
Titan One Tube RT-PCR System	11855476001
KiCqStart One-Step Probe RT-qPCR ReadyMix	KCQS07
KAPA PROBE FAST One-Step	KK4752
M-MLV Reverse Transcriptase	M1302
RNAseZAP	R2020
SYBR Green JumpStart Taq ReadyMix	S4438
TRI reagent	T9424
SYBR Green Quantitative RT-qPCR Kit	QR0100
Quantitative RT-PCR ReadyMix	QR0200
Milli-Q IQ 7000 Water System	ZIQ7000T0
BioPak application pak	CDUFBI001

Инструменты для исследования вирусных белков

Гели и колонки для аффинной хроматографии, а также готовые к использованию буферные растворы для клеточного лизиса позволяют проводить быструю экстракцию вирусных белков для сокращения времени исследования и повышения точности результатов. Узнайте, как использовать метод вестерн-блоттинга для подтверждения результатов очистки вируса.
Недавно было установлено, что исследования белок-белковых взаимодействий имеют высокую важность для всестороннего изучения Covid-19. Для подтверждения протекания эндогенных белок-белковых взаимодействий можно использовать технологию Duolink PLA (метод близкого лигирования) с последующим считыванием результатов методом микроскопии или цитометрии в потоке.

Описание	№ в каталоге
HIS-Select Nickel Affinity Gel	P6611
Protein A-Sepharose	P3391
RIPA Buffer	R0278

Редактирование генов

Реагенты для нокаута или нокдауна генов рецептора ACE2 или иных генов, задействованных при поражении SARS-CoV-2 по технологии shRNA или CRISPR в плазмидном, лентивирусном или синтетическом формате.

Для получения более подробной информации о редактировании генов перейдите на страницу Merck, посвящённую достижениям геномики.

• shRNA ACE2

• CRISPR ordering

Библиотеки функциональной геномики CRISPR и RNAi для подбора инструментов для скрининга генов, делающих клетку более восприимчивой или устойчивой к инфицированию, репликации и развитию COVID-19, что позволяет разрабатывать генетические тесты, которые можно использовать в качестве вторичной диагностики при оценки риска осложнений COVID, а также риска инфицирования.

Описание	№ в каталоге
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine/Growth Factor Panel A - Immunology Multiplex Assay	HCYTA-60K
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine/Growth Factor Panel A 38 Plex Premixed Magnetic Bead Panel - Immunology Multiplex Assay	HCYTA-60K-PX38
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine/Growth Factor Panel A 38 Plex Premixed Magnetic Bead Panel – BULK (Space Saver) PACKAGING - Immunology Multiplex Assay	HCYTA-60K-PXBK38
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine/Growth Factor Panel A 48 Plex Premixed Magnetic Bead Panel - Immunology Multiplex Assay	HCYTA-60K-PX48
MILLIPLEX MAP Human Cytokine/Chemokine/Growth Factor Panel A 48 Plex Premixed Magnetic Bead Panel – BULK (Space Saver) PACKAGING - Immunology Multiplex Assay	HCYTA-60K-PXBK48