Горизонтальный электрофорез: оборудование и расходные материалы

В данном обзоре представлен метод электрофореза нуклеиновых кислот горизонтального (далее — НК), области его применения, оборудование, необходимое для проведения анализа, а также необходимые реагенты и расходные материалы для его реализации. Особое внимание уделено гель-документирующим системам.

Электрофорез представляет собой метод анализа и разделения биологических молекул (НК и белков) на основе их электрического заряда и размера при воздействии электрического поля. Этот метод широко применяется молекулярными биологами и генетиками для исследования НК и белков. Для разделения биологических молекул с помощью электрофореза используются агарозные и полиакриламидные гели в качестве матрицы.

Существует два основных вида электрофореза нуклеиновых кислот: горизонтальный и вертикальный.
Электрофорез в горизонтальной плоскости часто применяется для оценки более крупных фрагментов ДНК: после рестрикции, части ДНК, содержащейся в векторах клонирования, например.

Вертикальный электрофорез обладает более высокой разрешающей способностью и применяется для разделения фрагментов молекул ДНК/РНК, различающихся по размеру на несколько пар нуклеотидов, что позволяет исследователям анализировать генетические мутации, проводить сравнительный геномный анализ, исследовать полиморфизмы (SNP) на наличие или отсутствие конкретных аллельных вариантов.

Оба подхода используются для разделения и анализа НК, однако выбор конкретного метода зависит от характеристик исследования, типа образцов и поставленных целей.

Для проведения электроореза в горизонтальной плоскости используются горизонтальные электрофоретические камеры. Они оснащены электродами, предназначенными для подачи электрического тока через гель, а также прозрачными крышками, через которые можно следить за ходом разделения молекул. Источники питания оснащены настраиваемыми параметрами напряжения, которые возможно варьировать с учетом величины геля и необходимой скорости разделения.

Камеры для электрофореза в горизонтальной плоскости

Электрофоретические камеры и источники питания от китайских производителей зарекомендовали себя как высококачественное и надежное оборудование, способное провести разделение до 108 образцов за 20 минут.

Характеристики электрофорезных горизонтальных камер

Электрофорезная горизонтальная камера	midiDNA, Wix 10101001	miniDNA, Wix 10102001	SVL-2, Servicebio
Максимальное количество образцов	108	32	25
Размер геля, мм	130×130 130×65 65×130 65×65	70×70 70×100	120×120 60×120 120×60 60×60
Рамки на гель, число	1-4	1	4
Гребенки	0,75 мм: 7+7/14 лунок 0,75 мм: 9+9/19 лунок 1,0 мм: 12+12/27 лунок 1,5 мм: 7+7/14 лунок 1,5 мм: 9+9/19 лунок 2,0 мм: 3+3/3+2 лунок	0,75 мм: 9/16 лунок 1,0 мм: 9/16 лунок 1,5 мм: 9/16 лунок	1 мм на 25/11 лунок 1,5 мм на 13/6 лунок 2 мм на 3/2 лунок
Буфер, объем, мл	1000	260	260
Особенности	—	—	Трансиллюминатор (синий свет, длина волны), нм — 470
Цена, руб.	39 345	29 950	28 927

Источники питания

Источники питания для электрофореза — это устройства для генерации стабильного и контролируемого электрического поля, которое требуется, чтобы перемещать молекулы НК в матрице. Разнообразные типы источников питания отличаются как, так и возможностью одновременного подключения от одной до нескольких камер. Источники питания для электрофореза обладают рядом характеристик, которые делают их оптимальными для этой задачи: параметрами мощности (электрическое сопротивление и напряжение), программируемые параметры, цифровой дисплей. Параметры источников питания варьируются от модели и производителя, что позволяет подобрать наилучшие параметры в соответствии с задачами. Источники питания являются важной частью лабораторного оборудования для электрофоретического разделения молекул и обеспечивают надежное и контролируемое перемещение молекул через систему (гель+буфер) для достижения желаемых результатов эксперимента.

Характеристики источников питания

Источники питания	EP300, Wix 10105001	EP600, Wix 10107001	EP3000, Wix 10118001	Эльф-4, ДТ О-ELF4	Эльф-8, ДТ О-ELF8	SPW-DSE, Servicebio, SPW-DSE	SPW-6S, Servicebio, SPW-6S
Характеристики	10-300 В 1-400 мА 75 Вт 4 выхода	10-600 В 1-1200 мА 1-500 Вт 4 выхода	5-250 В 1-3000 мА 1-300 Вт 4 выхода	5-400 В 5-400 мА 0,5-80 Вт 2 выхода	10-800 В 3-200 мА 0,5-80 Вт 2 выхода	6-500 В 6-500 мА 250 Вт 4 выхода	6-600 В 5-600 мА 300 Вт 4 выхода
Цена, руб.	73 240	102 780	147 030	65 200	79 340	90 396	62 195

Система Mupid, Япония — камера, оборудованная интегрированным съемным источником питания

Системы Mupid — это надежный и эффективный инструмент для экспресс-анализа НК. Они имеют вынимающийся источник питания, а также семь вариантов выходных напряжений.

Характеристики электрофорезных горизонтальных систем Mupid

• Объем буфера, мл — 270-320;
• размер гелей/число лунок — 125×60 мм, 125×122 мм / 26 лунок по 2 мм, интервал 4,5 мм, 13 лунок по 6 мм, интервал 9 мм;
• производительность — до 104 образцов (26×4 ряда);
• столик для заливки, размер, Ш×Д×В, мм — 149×125×20;
• подложка для геля 125×60 мм, размер, Ш×Д×В, мм — 130×59,5×13;
• подложка для геля 125×122 мм, Ш×Д×В, мм — 130×122×13;
• источник питания:
• таймер 0-99 мин, имеется опция паузы;
• автосохранение данных — напряжение, таймер;
• варианты напряжений (исходящих), В — 135/100/50/25/70/35/18.

Системы Mupid	Mupid-exU	Mupid-one
Возможность визуализации геля в камере	камера с подложкой пропускают ультрафиолетовое излучение.	набор для заливки гелей изготовлен из термоустойчивого пластика.
Цена, руб.	138 552	108 733

Гель-документирующее оборудование

Гель-документирующее оборудование является неотъемлемым инструментом для визуализации и оценки гелей, полученных в ходе электрофореза НК. Современные системы MINI Space от Tanon отличаются высокой сенситивностью и точностью детектирования, и легки в эксплуатации и имеют разнообразный набор функционала.

Характеристики гельдокументирующей системы MINI Space

• Изображение — 65535 оттенков серого;
• разрешение камеры, МП — 20;
• размер картинки, см — 14×21;
• сенсорный дисплей 12”;
• габариты, Ш×Г×В, см — 38×45×41.

Модель	MINI Space 1000	MINI Space 2000	MINI Space 3000
Камеры	Super Vision Camera 1000	Super Vision Camera 2000	Super Vision Camera 3000
Качество изображения, мп	(1836×2756) 5,6	(2056×3084) 6,34	(2316×3476) 8,05
LED источники света	белый/УФ/синий		белый/УФ/синий/ синий/зеленый/красный
Фильтры, нм	590	535/590	535/605/699
Фильтродержатель	нет	5-позиционный
Контроль лотка для образцов	ручной	автоматический
Цена, руб.	968 772	1 401 742		2 159 441

См. также:

Гель- и хемидокументирующие системы

Маркеры длин ДНК/РНК

Пипетки автоматические

Пробирки до 45 мл типа Эппендорф

Химические реактивы, препараты, наборы

Электрофорез

Ниже вы можете задать вопрос или оставить запрос в свободной форме: