Подготовка проб для секвенирования нового поколения (Next Generation Sequencing, NGS) является трудоемким процессом, требующим опыта и высочайшей точности. Автоматическая подготовка библиотеки для NGS на станциях EpMotion, Eppendorf уменьшает вероятность ошибок, обеспечивает воспроизводимость и производительность.
- Обширный список методов автоматической подготовки для NGS, подтвержденный производителями наборов и заказчиками, для получения результатов секвенирования, сравнимых с результатами, полученными в ходе подготовки вручную, или даже превышающих их по качеству.
- Интерфейс дает легкое и быстрое создание методов, обеспечивает гибкость для оптимизации даже самых сложных операций секвенирования нового поколения.
Станция EpMotion 5073m средней производительности для подготовки библиотек к NGS
- Объект выделения — геномная ДНК клеток и крови, вирусная ДНК и РНК;
- количество одновременно обрабатываемых образцов — 24;
- количество мест — 6;
- формат выделения — пробирки 0,2–50 мл, планшеты 96 и 384 лунки.
Предустановленные методы:
- Illumina 16S Metagenomic;
- AmpliSeq for Illumina;
- KAPA Library Quant Kit (LQK).
Станция EpMotion 5075t средней производительности для подготовки библиотек к NGS
- Количество одновременно обрабатываемых образцов — 96;
- формат — пробирки 0,2-50 мл, планшеты 96 и 384 лунки;
- количество рабочих мест — 15;
- встроенный термомиксер;
-
контроль температуры от 15 °С ниже комнатной до 95 °С;
-
автоматическая фиксация планшет, пробирок при скорости шейкера более 2000 об/мин.
Предустановленные методы для EpMotion 5075t:
- Ampliseq for Illumina: Cancer HotSpot Panel v2;
- Ampliseq for Illumina: Focus Panel;
- Ampliseq for Illumina: Comprehensive Panel Panel v3;
- Illumina TruSeq Stranded Total RNA (RiboZero);
- Illumina TruSeq Stranded mRNA;
- Illumina TruSeq Nano DNA;
- Illumina TruSeq DNA PCR-Free;
- Illumina TruSeq Rapid Exome;
- Illumina TruSeq RNA Exome;
- Illumina TruSeq Custom Amplicon Low Input;
- Illumina TruSight HLA v2;
- Illumina TruSight Tumor 15;
- Illumina TruSight RNA Pan Cancer;
- Illumina TruSight RNA Fusion;
- Illumina TruSight Cancer/TruSight Enrichment;
- Illumina TruSight Rapid Capture;
- Illumina TruSight One;
- Illumina Nextera XT DNA;
- Illumina Nextera Rapid Capture Custom Enrichment;
- Illumina Nextera DNA Flex;
- Illumina Nextera Flex for Enrichment;
- KAPA HyperPrep;
- KAPA mRNA HyperPrep;
- KAPA HyperPlus;
- KAPA HTP LPK;
- KAPA Stranded RNA Seq;
- KAPA Library Quant.
|
|
|
Также многими пользователями уже на рабочем месте были удачно интегрированы методы под следующие наборы:
- Illumina Nextera Rapid Capture Exome;
- Illumina ForenSeq;
- KAPA RNA HyperPrep;
- KAPA mRNA Seq;
- KAPA Ribo Erase;
- Agilent HaloPlex;
- Agilent SureSelect XT;
- New England Biolabs NEBNext Ultra;
- New England Biolabs NEBNext Ultra II;
- Qiagen QIAseq FX;
- Qiagen GeneRead Panel.
Методы для других наборов и производителей в процессе разработки и в скором времени также будут интегрированы в ПО станций.
Для всех моделей EpMotion:
- предустановленные методы подготовки библиотек NGS;
- возможность установки планшетов и штативов с наконечниками один на другой, для увеличения производительности / удобства;
- информирование пользователя по электронной почте о стадии пробоподготовки;
- полностью рабочая комплектация с набором необходимых аксессуаров и расходных материалов;
- система интеллектуального выбора дозирующего модуля (1-или 8-канальный) (для EpMotion 5075t).
Блок
CleanCap — УФ-лампа и HEPA-фильтр для деконтаминации и очистки воздуха, встроенные в крышку станции.