Oxford Nanopore Technologies — это нанопоровые секвенаторы третьего поколения
MinION,
GridION и
PromethION.
Технология секвенирования
Oxford Nanopore Technologies позволяет делать прямое прочтение цепей ДНК или РНК в режиме онлайн, длина рида ограничена только длиной фрагмента, а портативность оборудования и быстрая подготовка библиотек дает возможность секвенировать даже в полевых условиях с минимальными требованиями к генетической лаборатории. С
Oxford Nanopore Technologies
секвенировать теперь может каждый, даже тот, кто ранее и не задумывался о секвенировании — это просто и доступно.
Применения нанопорового секвенирования:
- полногеномное секвенирование;
- заполнение пробелов недостающих при секвенировании коротких фрагментов;
- быстрая онлайн идентификация патогенов и профилирование антибиотикоустойчивости;
- анализ структурных вариаций;
- анализ микробиома;
- экологические и клинические исследования.
Примеры использования >>>
Наборы для нанопорового секвенирования.
|
|
Нанопоровое секвенирование (секвенирование третьего поколения) не заменяет и не отменяет применение
капиллярных секвенаторов по Сэнгеру или
платформ NGS второго поколения. Наоборот, сочетание трех поколений генетического анализа открывает новые возможности получения ранее неизвестных данных.
MinlON — карманный секвенатор, одна проточная ячейка, до 20 Гб данных.
GridlON — настольный секвенатор, 5 проточных ячеек — 2560 каналов с нанопорами.
PromethION — самый высокопроизводительный секвенатор, существующий на сегодняшний день, 48 проточных ячеек — 144 000 каналов с нанопорами.
MinIT (доступен с 2019 г.) — карманный компьютер для работы с секвенатором
MinION.
VolTRAX — портативный прибор для автоматической подготовки библиотек.
Flongle — адаптер для
MinION и
GridION, для работы с одноразовыми ячейками.
SmidgION — секвенатор для смартфона (находится в разработке).
Специалисты
Стар-лаб
прошли обучение в
Oxford Nanopore Technologies, осуществляют профессиональное консультирование и техническую поддержку, помогут спланировать эксперимент и подобрать необходимые наборы реагентов для решения конкретной задачи. Вы также можете заказать нанопоровое секвенирование в лаборатории
Стар-лаб, связавшись с Кристиной Яковлевой
ky@star-lab.am, (495) 745 05 08 доб.109.